Арсен Борисович впервые «засветился» в политике во время избирательной кампании 2004 года в должности заместителя главы Харьковского регионального штаба кандидата в президенты Виктора Ющенко, напоминает Википедия. После инаугурации последнего Аваков был избран в совет партии «Наша Украина» и вошел в ее президиум. Через пять лет, в 2010 году, вступил в партию «Батькивщина» и согласился возглавить харьковскую областную организацию. В этом же году на местных выборах баллотировался в мэры Харькова, но проиграл Геннадию Кернесу.
В январе 2012 года прокуратура Украины открыла против Авакова уголовное производство по факту превышения власти и должностных полномочий, повлекших тяжкие последствия. Речь шла о незаконном изменении целевого назначения и передаче в частную собственность более 55 га земли государственного назначения стоимостью свыше 5,5 млн гривен. 31 января 2012 года Арсен Борисович был объявлен в международный розыск, так как скрылся в Италии. В марте того же года итальянский суд арестовал его на 40 суток. В это время украинская сторона начала сбор необходимых для экстрадиции документов. Впрочем, уже в апреле 2012 года Аваков был освобожден из-под стражи, а в начале октября итальянский суд отказал Украине в экстрадиции политика. На парламентских выборах 2012 года Арсен Аваков был избран народным депутатом по спискам объединенной оппозиции от «Батькивщины» и вернулся на родину. До последнего времени возглавлял подкомитет в комитете Верховной рады по вопросам регламента, депутатской этики и обеспечения деятельности парламента.
За свою политическую карьеру он семь раз попадал в коррупционные скандалы. В частности, в принадлежащем Авакову банке «Базис» выдавались миллионные кредиты физическим лицам. Залогом выступали векселя или имущество, впоследствии передававшиеся другим предприятиям, которые проходили процедуру банкротства, — и таким образом имущество уходило «в никуда». А деньги переводились на счета других фирм и в конечном итоге — в офшорные зоны. Автором схемы был Арсен Аваков.
В частности, 30 августа 2012 года губернатор Харьковской области Михаил Добкин предложил от имени сессии облсовета обратиться к правоохранительным органам Италии и рассказать им о деятельности банка «Базис», имеющего отношение к экс-губернатору Арсену Авакову. Это предложение он сделал после выступлений на сессии руководителей предприятий и учебных заведений, пострадавших от деятельности банка «Базис».
Тогда гендиректор ОАО «Турбоатом» Виктор Субботин заявил, что его предприятие потеряло 135 миллионов гривен, руководитель ПАО «Свет Шахтера» Геннадий Высоцкий назвал сумму в 13 миллионов гривен (речь идет и о самом заводе, и о связанных с ним предприятиях), ректор Харьковского национального медицинского университета Владимир Лисовой — около 8 миллионов гривен, председатель правления АК «Харьковоблэнерго» Сергей Кирик — около 7 миллионов, пишет Polemika.com.
Арсен Аваков как физическое лицо выступает соучредителем нескольких благотворительных структур: Фонд им. Марианны Аваковой, благотворительная организация «Звездный мост», благотворительный фонд «Ренессанс».
В феврале 2008 года журнал «Фокус» в списке 130 богатейших украинцев поставил Авакова на 67-е место. Эксперты издания оценили состояние губернатора Харьковщины в $385 млн. При этом было отмечено, что годом ранее оно равнялось $300 млн. По данным журнала «Фокус» к 2011-му его состояние уменьшилось до 282,9 млн долларов (65-е место). В 2013 году его состояние составляло 98,9 млн долларов (118-е место рейтинга «200 самых богатых людей Украины»). Вероятно, полагают некоторые СМИ, это была плата за экстрадицию из Италии.
АКБ «Базис» зарегистрирован Нацбанком Украины в 1992 году. Располагает филиалами в Днепропетровске и Киеве. В мае 1995-го в него влился бывший филиал Харьковского инвестиционного коммерческого банка по развитию легкой промышленности «Интерстройбанк». Среди партнеров банка — АО «Инвестор», АО «Турбоатом», ЗАО «Теплоэлектроцентраль-3», Областное коммунальное предприятие «Харьковские теплосети», КП «Харьковские тепловые сети», ОАО «УЦЭБОТнефтегаз», ЗАО «Хлебозавод Салтовский», ООО «Украинская чайная фабрика «АхмадТИ», Дублянский спиртовой завод, Новопокровский государственный комбинат хлебопродуктов. «Базис» входит в состав финансово-промышленной группы «Инвестор». Учредитель и владелец контрольного пакета акций (50,55 % уставного капитала банка) — АО «Инвестор», основным «контролером» которого называют Авакова. По данным «Фокуса», ФПГ «Инвестор» координирует деятельность порядка 40 разноотраслевых предприятий. В том числе в сфере энергетики, по производству и продаже в Украине популярной марки чая «Ахмад».