При объединении Русского государства остров вместе с другими новгородскими территориями вошел в состав Московского княжества, однако, находясь в приграничной со Швецией зоне, этот край нередко страдал от набегов варягов, грабивших и сжигавших деревянные постройки. Однако камень на острове брать было неоткуда, поэтому новые храмы и дома возводились по-прежнему из дерева. Страдали кижичи и от природных напастей: от удара молнии в начале XVIII в. сгорела одна из старинных церквей острова, ив 1714 г. на ее месте была заложена 22-главая церковь Преображения Господня — одна из жемчужин современных Кижей. По местным, преданиям план церкви чертил сам Петр I, а возвел 37-метровый храм из местной сосны талантливый русский мастер, так и оставшийся неизвестным.
Северорусские крестьяне обладали гордым, независимым и несгибаемым характером. Не удивительно, что на любые принуждение или несправедливость они отвечали бунтом. В конце XVII в. в ответ на организацию принудительных работ на металлургических заводах Заонежья кижские крестьяне ответили восстанием, которое всколыхнуло весь Север Руси.
В основе постройки церкви — типичный для северного зодчества деревянный сруб, выполненный без гвоздей, хотя, разумеется, гвозди использовались при окончательной отделке храма. Основа храма представляет собой 3 восьмигранника, или восьмерика; на нижний, самый большой по размеру восьмерик поставлены еще два сруба меньших размеров. Нижний ярус дополнен четырьмя прямоугольными прирубами, которые выставлены точно по сторонам горизонта и в завершенном виде представляют собой крест. На востоке храмовый комплекс продолжен увенчанным главой алтарем, с запада к храму примыкает трапезная. Каждый ярус украшен главами различных размеров и конфигураций, придающих композиции завершенный вид.
Вторая старинная церковь — Покрова Пресвятой Богородицы, которую сегодня тоже можно увидеть на острове, была возведена на полстолетия позже Преображенской. Перед древнерусским архитектором стояла непростая задача — вписать новую церковь в уже существующий храмовый комплекс, не затеняя, а подчеркивая красоту и величественность главной церкви Кижей. Сделано это было с гениальной простотой: зодчий не противопоставил, а подчинил композицию новой церкви уже существующей, сделав ее предельно простой. В Покровской церкви всего 9 главок, 8 из которых окружают центральную. Деревянные купола безыскусны, но в то же время изящны по своим пропорциям и отделке. В отличие от пирамидальной композиции церкви Преображения Господня Покровская построена иначе — в виде единого восьмерика, немного расширенного в верхней части.
Самое поразительное в старинных кижских церквах — не тонкость резьбы по дереву, не грандиозность сооружения, не величественность, хотя всего этого в древних храмах с избытком; наибольшее впечатление производят удивительная соразмерность, гармоничность культовых сооружений человеку, его душевным запросам и потребностям. При всем обилии глав, пышности украшений, прихотливости линий, сложности и необычности композиций церкви не кажутся вычурными, избыточно декоративными: в них каждая деталь несет особую смысловую нагрузку и видится оправданной; кажется, в этих постройках слились воедино крестьянское прямодушие с христианской простотой и безыскусностью. Церкви чем-то неуловимо напоминают русские терема, затейливые и одновременно непосредственные. Недаром, по словам летописи, мастер, закончив работу, выбросил в озеро единственный свой инструмент — топор, сказав при этом, что никогда и никто не сможет повторить подобной красоты. И сегодня, как и сотни лет назад, храм не перестает поражать своей органичной красотой, вырастая из земли, со всех сторон окутанной онежскими туманами; он всеми своими 22 главами устремляется к солнцу, небу, Богу, славя в веках уникальность замысла талантливого мастера.
В Кижах доступно увидеть не только древний погост, здесь можно в подробностях ознакомиться с бытом людей, населявших северные губернии России. На сегодняшний день в музее легко увидеть более 30 000 предметов, некогда использовавшихся в быту карельскими крестьянами, для знакомства с дореволюционным бытом жителей Карелии в Кижах устроены экспозиционные деревни Ямка и Васильево, в которых и сегодня продолжают проживать люди, с удовольствием рассказывающие о древнерусском быте.
