Часто подводникам поручались особые задания, например внезапный захват отдаленных полярных радиостанций. В 1942 году «серые волки» из своих 88-миллиметровых орудий обстреливали советские береговые радиостанции. Предпринимались и попытки заправлять горючим с этих импровизированных «опорных пунктов» самолеты. Несмотря на большие трудности — многие самолеты разбивались на волне, — такие заправки все-таки осуществлялись и позволяли расширить возможности дальней воздушной разведки. До самого конца войны германская воздушная разведка в направлении Исландии и Шетлендских островов оказывала весьма существенную помощь подводным лодкам при их действиях против конвоев союзников.
Совместные действия германских подводных лодок с надводными кораблями в Заполярье составляют особую главу в истории Второй мировой войны. Субмарины выполняли в таких случаях задачи не только разведки, но и прикрытия, как это имело место при прорыве броненосца «Адмирал Шеер» в Карское море и при артиллерийском обстреле линейными кораблями «Шарнхорст» и «Тирпиц» укрепленных пунктов на Шпицбергене. Планировались и совместные действия по уничтожению конвоев. Они проводились в тех случаях, когда это считалось возможным, однако при их выполнении постоянно приходилось сталкиваться с непредвиденными осложнениями.
Опорные пункты подводных лодок в этом районе также имели свои характерные особенности. В Киркенес, Гаммерфест, Харстад и Нарвик были доставлены плавучие судоремонтные мастерские и плавучие казармы.
Понятно, что и немецкие пути сообщений, проходившие морем вдоль норвежского побережья, не были безопасны, ибо здесь действовали английские подводные лодки, эсминцы, торпедные катера и самолеты. Поэтому обеспечение германских войск, находившихся на севере Норвегии, было связано с немалыми трудностями, которые, после того как германская авиация потеряла господство в воздухе, усилились еще более. Для доставки таких важных грузов, как, например, торпеды, частично использовались специальные транспортные подводные лодки. Однако на Северном Ледовитом океане эти лодки встречали обстановку, сходную с условиями Бискайского залива. Даже эскортируемые транспортные подводные лодки гибли в шхерах.
Задания, казавшиеся в других местах обычными и нормальными, здесь превращались в сложные проблемы. Основные трудности, стоявшие перед подводными лодками в Заполярье, заключались в сложных навигационных условиях. Трудно было точно определить свое место в море из-за туманов, частых осадков и постоянно меняющейся видимости. Плавание в ледовой обстановке вызывало частые повреждения самих лодок и их оснащения. Особо сложными были атаки в период светлых ночей полярного лета. В бесконечно долгую полярную ночь выследившая конвой лодка совершенно неожиданно могла оказаться в самом его центре под светом ярко вспыхнувшего северного сияния.
Когда опасность вторжения англичан в Норвегию уже не вызывала тревоги у немцев, с 12 марта 1942 года 20 подводных лодок получили новую задачу: воспрепятствовать перевозкам грузов в Мурманск и Архангельск. Западные державы осуществляли снабжение Советского Союза военными материалами тремя путями: через порты Северного Ледовитого океана, Иран и Владивосток. Направлявшиеся через Владивосток транспорты были вне досягаемости для немецких атак, на поставки через Иран можно было влиять лишь косвенно, в рамках общей подводной войны.
Тем важнее было обеспечить уничтожение к тому же и наиболее многочисленных конвоев, направлявшихся в советские северные порты. Борьба на этих коммуникациях наряду с материальным ущербом противнику могла принести существенную выгоду в стратегическом отношении, ибо при этом сковывались крупные силы английского флота, которые союзникам постоянно приходилось выделять для прикрытия конвоев.
21 августа 1941 года из Англии в СССР вышел первый конвой, в охранении и прикрытии которого находились авианосец, два крейсера, пять эсминцев и три тральщика. Конвои, направлявшиеся в СССР, обозначались литерами PQ, а те, что возвращались обратно, — QP. Это были инициалы морского офицера П. К. Эдвардса, ответственного за планирование конвоев. До конца 1941 года по этой новой внешней коммуникации Советского Союза прошло в обоих направлениях 13 конвоев, в том числе девять конвоев с запада на восток. Из 103 судов их состава немецкой субмариной, одной из первых, направленных в Арктику, был потоплен только один транспорт. Никто из союзников тогда не придал серьезного значения этому инциденту, который по сути являлся важным предупреждением. Германское командование также не уделило серьезного внимания переброске военных материалов в советские порты. Гитлер тогда еще был убежден в быстром завершении русской кампании.
