Отслужив положенный срок в действующем флоте, корабли переводились в первый резерв, в составе которого линейные корабли и броненосные крейсера состояли еще десять лет, а корабли других классов — до утраты боеспособности. Они должны были быть готовы выйти в море в течение 48 часов. При этом их материальная часть должна была находиться в полной исправности.
Личный состав на кораблях первого резерва предполагалось иметь не менее двух третей от положенного комплекта нижних чинов и не меньше половины младших механиков, врачей, командира, старшего офицера и старшего механика. В случае мобилизации численность экипажа должна была составить сто процентов.
Во второй резерв переводились корабли, не удовлетворявшие требованиям первых двух категорий. Они комплектовались личным составом на одну треть.
Классификация кораблей также периодически претерпевала изменения, связанные с развитием техники и реализацией новых кораблестроительных программ. Последний раз в Российской империи она была утверждена в июне 1915 г. и предусматривала следующие классы кораблей:
1) линейные корабли,
2) линейные крейсеры,
3) крейсеры,
4) эскадренные миноносцы,
5) миноносцы,
6) подводные лодки,
7) заградители,
8) тральщики,
9) канонерские лодки,
10) речные канонерские лодки,
11) учебные суда,
12) транспорты,
13) посыльные суда,
14) яхты,
15) гидрографические суда,
16) портовые и крепостные суда,
17) блокшивы.
Затем классификация была дополнена 18-м классом (морские и портовые ледоколы) и 19-м (сетевые заградители). В 1917 г. в особый класс выделили сторожевые суда, сторожевые катера-тральщики
Организационная структура флота состояла следующая. Силы флота на морском театре военных действий возглавлял командующий морскими силами (положение о введении этой должности было высочайше утверждено 9 мая 1911 г.), являвшийся одновременно командующим эскадрой моря. Ему подчинялись действующий флот и резервы 1-й и 2-й очереди. Он отвечал за боевую подготовку и отработку планов ведения боевых операций. Командиры бригад и дивизионов несли ответственность за боевую подготовку своих соединений и обеспечение их всеми видами довольствия. Непосредственно командующему эскадрой подчинялись бригада подводных лодок и дивизия (партия) траления. Бригады линейных кораблей и крейсеров состояли из четырех кораблей, сведенных в два дивизиона двухкорабельного состава.
В первые бригады, как правило, включали наиболее современные и боеспособные корабли. Минная дивизия состояла из шести дивизионов четырехкорабельного состава Каждый из дивизионов делился на полудивизионы. При необходимости число кораблей в дивизионе могло быть увеличено. Кроме того, дивизионам зачастую придавались крейсера или более современные корабли в качестве лидеров.
Устаревшие торпедные корабли старались сохранять в одном соединении, но на практике это удавалось сделать крайне редко. Нумерация дивизионов в принципе соответствовала возрасту кораблей. Дивизионы, начиная с 7-го, использовались для вспомогательных целей (эскортной, дозорной и брандвахтенной службы, минных постановок) и не действовали совместно с эскадрой, хотя находились в распоряжении командующего. Дивизия подводных лодок также состояла из шести дивизионов, но их нумерация зависела от уровня боеготовности входивших в их состав кораблей. Численность лодок в одном дивизионе могла варьироваться от четырех до восьми единиц. Дивизия траления состояла из нескольких отрядов. Отряды (соединения кораблей меньшего, чем эскадра состава) могли находиться в распоряжении командующего эскадрой либо командиров специально созданных соединений. В 1916 г. эскадры были упразднены и создан институт командующих флотом, в ведении которых находилась вся военно-морская деятельность на том или ином ТВД. При этом побригадное и подивизионное деление боевых кораблей продолжало сохраняться.
На Балтийском море в состав действующего флота входили: бригада линейных кораблей, бригада крейсеров, две минные дивизии эскадренных миноносцев, бригада подводных лодок и отряд заградителей. После вступления в строй балтийских линкоров типа «Севастополь» из них сформировали 1-ю бригаду линейных кораблей, а устаревшие броненосцы перевели во 2-ю бригаду.
