Ряд изменений в системе органов управления флотом произошел в период после Февральской революции. 7 марта 1917 г. все центральные учреждения морского ведомства были подчинены помощнику морского министра, за исключением МГШ, оставшегося в непосредственном подчинении министра.
8 мая был сформирован Походный штаб морского министра. Штаб должен был стать рабочим органом управления оперативного управления флотом. 13 июня Походному штабу подчинили редакцию журнала «Морской сборник». 1 июня последовал приказ по Походному штабу морского министра, в соответствии с которым помощник морского министра — начальник Морского генерального штаба — стал именоваться первым помощником министра с освобождением от должности начальника Морского Генерального штаба. Помощник морского министра стал вторым помощником министра Первому помощнику министра были подчинены МГШ, ГМШ, Главное Военно-морское судное управление, Управление санитарной частью флота, канцелярия и архив Морского министерства. Второму помощнику — Главное управление кораблестроения, Главное морское хозяйственное управление, Управление морской строительной части, Главное гидрографическое управление, Постоянная комиссия для испытаний судов военного флота и Управление по делам рабочих и вольнонаемных служащих.
6 июня 1917 г. ГМШ был переформирован в Главное управление по делам личного состава Существовавшие к тому времени в составе штаба мобилизационное, организационное, пенсионное отделения и отделение общих дел упразднили, а вместо них создали офицерский, матросский и распорядительный отделы. В составе последнего находились адъютантская часть, канцелярия и казначейская часть.
Вслед за этим приказом от 14 июля 1917 г. было объявлено постановление Адмиралтейств-Совета, принятое еще 13 апреля, в соответствии с которым учреждалось Управление военно-морских учебных заведений с подчинением его Главному морскому штабу.
Приказом по флоту и морскому ведомству от 29 июля 1917 г. на базе отдела воздушного плавания Главного управления кораблестроения было сформировано самостоятельное Управление морской авиации и воздухоплавания.
Подобное решение приняли и в отношении подводных сил флота: 14 августа 1917 г. приказом по канцелярии Морского министерства отдел подводного плавания Главного управления кораблестроения был преобразован в Управление подводного плавания.
Формально все учреждения Российского флота оказались ликвидированы 29 января (11 февраля) 1918 г., когда председатель Совнаркома В.И. Ульянов (Ленин) подписал Декрет о создании Рабоче-Крестьянского Красного Флота, в котором говорилось: «…флот, существующий на основании всеобщей воинской повинности царских законов, объявляется распущенным и организуется социалистический Рабоче-крестьянский Красный Флот». Фактически развал флота как боевой организации к этому моменту завершился полностью. Массовая деморализация матросских масс, вызванная в основном либеральными решениями Временного правительства и подогреваемая пропагандой большевиков, вылилась в такие страшные формы, как жестокое истребление офицеров. Покинутые командами корабли приходили в негодность.
Говоря о системе управления Российским Императорским флотом в период 1905–1917 гг., можно отметить, что его эффективность значительно повысилась по сравнению с периодом, предшествующим Русско-японской войне 1904–1905 гг. Несмотря на незавершенность многих планов строительства флота, в целом готовность морских сил к началу войны была достаточно высока.
II. Организация Российского флота в 1914–1918 гг
Перед Первой мировой войной существовала классификация кораблей военного флота с разделением его на «действующий», 1-й и 2-й резервы. В состав действующего флота зачислялись корабли, полностью удовлетворявшие современным боевым требованиям. Для линейных кораблей и броненосных крейсеров срок службы определялся в десять лет. Крейсера и минные корабли оставались в действующем флоте до тех пор, пока их характеристики соответствовали современным условиям Корабли действующего флота должны были постоянно находиться в боевой готовности, т. е иметь исправную материальную часть, полный комплект команды и быть снабженными всем необходимым для похода. Они находились в походе ежегодно, оставляя два месяца в году для отдыха личного состава и ремонта.