Мусульманский комиссариат был одним из самых крупных в Наркомнаце. Его деятельность распространялась на Поволжье, Прикамье, Урал и другие районы России, где проживало мусульманское население.
Мулланур Вахитов проявил себя как большой знаток нужд, и запросов трудящихся-мусульман. Первые же проведенные по его инициативе мероприятия укрепляли доверие мусульман к Советской власти. 24 января 1918 года за подписью И. В. Сталина и М. Вахитова в Исполнительный комитет Оренбургского Совета рабочих и солдатских депутатов было передано такое распоряжение: «Просим опубликовать во всеобщее сведение, что по решению Народного комиссариата по делам национальностей Башкирский Народный Дом и мечеть под названием «Караван-Сарай» в Оренбурге передаются в полное распоряжение башкирского трудового народа в лице Областного Совета башкир». В этот же день Исполкому Казанского Совета было передано распоряжение о передаче башни «Сумбеки» в Казанском кремле «в полное распоряжение мусульманского трудового народа в лице Мусульманского социалистического комитета».
Трудовой мусульманский народ сплачивался вокруг Советской власти, но контрреволюция не унималась. Всероссийский мусульманский военный совет («Харби-Шуро»), опираясь на сформированные им еще до Октябрьской революции мусульманские воинские части (мусульманский корпус генерала Сулькевича, мусульманские полки в Петрограде, Казани, Уфе и других городах), вкупе с Всероссийским мусульманским советом («Милли-Идарэ») сделал попытку создать на территории Поволжья и Приуралья буржуазную «Волжско-Уральскую республику» («Идель-Урал штаты»).
Еще в начале января 1918 года в Казани был созван II Всероссийский мусульманский военный съезд, на который собрались представители контрреволюционной татарской буржуазии, мусульманского духовенства и татарского белого офицерства. Съезд заседал два месяца, обсуждая вопросы создания «Идель-Урал штатов» и организации национальной армии. На 1 марта в Казани была назначена контрреволюционная демонстрация — торжественное провозглашение буржуазной республики. Но этот план татарской контрреволюции был сорван. Казанский Совет рабочих и солдатских депутатов своевременно раскрыл заговор и быстро ликвидировал его. Главари съезда были арестованы.
Вскоре после этого татарская буржуазия пошла на более гнусную авантюру, она организовала так называемую «Забулачную республику» (в Казани, за речкой Булак). В этой части города контрреволюция, захватив власть в свои руки, создала из буржуазных сынков и преступных элементов «железные дружины» и готовилась к вооруженной борьбе с Советской властью.
Просуществовавшая около месяца контрреволюционная «Забулачная республика» 28 марта 1918 года была ликвидирована.
В ликвидации «Забулачной республики» участвовали сформированный в Казани местным мусульманским комиссариатом мусульманский социалистический батальон и матросский бронеотряд Соболева, прибывший из Москвы по настоянию Мулланура Вахитова.
В разгроме татарской контрреволюции решающую роль сыграло принятое Совнаркомом «Положение о Татаро-Башкирской Советской социалистической республике», которое выбило всякую почву из-под ног буржуазных сепаратистов.
Немаловажное значение имел и декрет Наркомнаца о немедленной ликвидации контрреволюционного всероссийского «Харби-Шуро» и связанных с ним окружных и гарнизонных комитетов. Этот декрет, подписанный И. В. Сталиным и М. Вахитовым, был опубликован в момент ожесточенной борьбы грудящихся Казани с националистической контрреволюцией за ликвидацию «Забулачки». В этом декрете, в частности, говорилось:
«Всякие самочинные организации, являющие попытку вырвать власть из рук мусульманских комиссариатов при Советах, объявляются контрреволюционными и подлежат немедленной ликвидации».
В апреле было ликвидировано контрреволюционное гнездо в Москве — Московское «Милли-Шуро» (Национальный совет), а через месяц — так называемое Национальное управление — «Милли-Идарэ».
Так, одна за другой, были подавлены контрреволюционные националистические организации. Большая заслуга в этом Мулланура Вахитова — председателя Центрального Мусульманского комиссариата при Наркомнаце.
