В 2005-м митрополитом Смоленским и Калининградским Кириллом рукоположен в диакона, а 2006-м — во священника. Считалось, что с будущим патриархом Говоруна связывали чуть ли не дружеские отношения, и, возможно, поэтому он пострижен в монашество с именем Кирилл. (Но на все добро Говорун ответил предательством.)
В 2008-м иеромонаха Кирилла (Говоруна) назначают председателем Отдела внешних церковных связей УПЦ МП. А в 2009-м патриарх Кирилл переводит его в Москву и назначает первым заместителем председателя Учебного комитета Русской Православной Церкви.
В середине 2009 года Говорун вдруг заявил, что с гетмана Мазепы может быть снята анафема. Руководитель пресс-службы УПЦ МП Василий Анисимов тогда иронично заявил, что о. Кирилл, делая подобные весьма сомнительные заявления, «поступает вполне по-мазепински».
В начале 2012 года достоянием гласности стала переписка архимандрита Кирилла. Как отметил председатель «Народного собора» Украины Игорь Друзь, в этой переписке он «обсуждает с киевскими клириками вопросы активизации агитации за «канонический откол» УПЦ МП от Русской Матери-Церкви, поливает грязью патриарха Кирилла и предлагает фактический подкуп украинского редактора Сони Кошкиной за деньги Патриархии (обещает ей поездку в Таиланд)».
В результате 15 марта 2012 года на первом же заседании весенне-летней сессии Священного Синода РПЦ архимандрит Кирилл (Говорун) был снят с должности первого заместителя председателя Учебного комитета РПЦ.
Почти одновременно открывается секретная переписка Госдепартамента США, выложенная на сайте Wikileaks. Выяснилось, что архимандрит Кирилл (Говорун) является информатором посольства США на Украине:
«В донесении от 9 января 2009 г. посол США на Украине Уильям Тейлор сообщал в Госдеп о беседе с архимандритом Кириллом:
В1. (Уровень секретности Sensitive But Unclassified (SBU)). Глава отдела внешних церковных связей УПЦ МП подчеркнул ее аполитичность на встрече с представителем посольства. Он признал, что позиция церкви в поддержку Януковича в 2004 г. была ошибочной, и подчеркнул независимость УПЦ МП как украинского филиала Русской Православной Церкви (РПЦ)… Он не исключил, возможность того, что Владимир может стать следующим патриархом РПЦ, но намекнул, что тот не был бы самым вероятным кандидатом.
В2. (SBU) Архимандрит Кирилл Говорун…, чтобы подчеркнуть мысль об ошибочности поддержки Виктора Януковича в 2004 г. на президентских выборах, отметил, что церковь стоит вне политики с 2004 г. Он также отметил, что церковь в 2007 г. публично осудила неофициальные православные группы, выступавшие с несанкционированными прорусскими заявлениями от имени церкви.
В3. (SBU) Говорун подчеркнул, что УПЦ МП декларирует свою независимость, как украинский филиал РПЦ. Он отметил, что лидеры РПЦ выразили неудовольствие решением Синода УПЦ от 20 декабря 2008 г. в поддержку кандидатуры Митрополита УПЦ МП Владимира на пост патриарха РПЦ. Хотя решение Синода УПЦ МП не являлось официальным выдвижением, а скорее, предложением Владимиру, это был сигнал о том, что УПЦ МП считает себя независимой. Отсюда Говорун делает заключение о том, что церковному руководству в Москве придется научиться принимать и уважать независимость Украины.
В5. (SBU) Говорун сказал, что участие президента Ющенко в праздновании 1020-летия Крещения Киевской Руси в июле 2008 г. почти вызвало раскол в УПЦ МП. Ющенко, который давно стремится создать единую православную Украинскую церковь, независимую от влияния Москвы, пригласил Вселенского Патриарха Константинопольского Варфоломея I, не посовещавшись с УПЦ МП… Говорун чувствовал, что Ющенко должен был посоветоваться с церквями перед приглашением Варфоломея.
В8. (SBU) Недавние события, похоже, подтверждают уверения Говоруна в том, что УПЦ-МП готова выражать свою точку зрения, не очень хорошо принимаемую в Москве. Например, в ноябре УПЦ МП выступила с заявлением о Голодоморе как геноциде. Мы также отметили, что Митрополит Владимир играл заметную роль в официальном отмечании Голодомора. ТЕЙЛОР»
…В 2016 году в Стамбуле пройдет Всеправославный собор. В истории христианской церкви было семь так называемых Вселенских соборов, последний из которых прошел еще в VIII веке. «Первый среди равных» Вселенский (Константинопольский) патриарх будет сидеть в окружении предстоятелей других поместных церквей. Никто не сядет во главе собрания — тем православный отличается от католического собора, где папа (Римский) возвышается над всеми. Все решения собора будут приниматься только общим согласием, без голосования.