С Юлией Тимошенко Юрий Продан знаком еще из тех времен, когда лидер БЮТ занимала должность вице-премьер - министра по вопросам топливно-энергетического комплекса. Тогда он был руководителем ДП «Энергорынок».
За свою карьеру фигурировал в нескольких коррупционных скандалах по неуплате налогов, нецелевому использованию кредитов и созданию коррупционных схем в отрасли, разворовыванию бюджетных средств в ядерно-энергетическом комплексе.
В сентябре 2005 года Генеральная прокуратура Украины возбудила уголовное дело по факту злоупотреблений в ОАО «Киевэнерго», свидетелями по которому проходят Юрий Продан и и. о. министра топлива и энергетики Иван Плачков. В частности, речь идет о четырех эпизодах: нецелевое использование счетов со специальным режимом; нанесение убытков компании «Газ Украины» в размере 150 млн грн, неуплата налогов и нецелевое использование кредита Мирового банка.
В 2006 году бывший директор «Укринтерэнерго» Олег Бугаев предъявил обвинение министру Ивану Плачкову и его первому заместителю Юрию Продану в организации коррупционных схем и личных бизнесов-интересов в энергетическом секторе Украины. В частности, речь шла о том, что руководство Минтопливэнерго создало монопольное положение на рынке юридических услуг в энергетическом секторе для компании «АРКА», основателями которой были Светлана Плачкова (жена Ивана Плачкова) и Елена Березовская — жена Юрия Продана. Министр топлива и энергетики говорит, что 20 % акций, которыми его жена владеет в компании «АРКА», не позволяют ей серьезно влиять на работу компании, пишет «Полит Рада».
В сентябре 2007 года секретарь следственной комиссии по расследованию нарушений в газовой сфере, народный депутат Александр Голубь заявил, что бывший первый заместитель министра топлива и энергетики Юрий Продан несет полнейшую ответственность за газовые договоренности 2006 года, повышение цены на газ и электроэнергию, а также за продажу стратегического запаса урана в 2005–2006 годах, разворовывание бюджетных средств в ядерно-энергетическом комплексе.
В феврале 2008 года Юрий Продан заявил, что Министерство топлива и энергетики намерено возвратить в «Днипроэнерго» тот объем акций, который раньше был в государстве.
«Днипроэнерго» был кулуарно продан… поэтому мы уже обратились в суды и работаем в них, чтобы возвратить целиком тот объем акций, который размыл государственную часть», — подчеркнул министр («Фраза», 15 февраля 2008 г.). Как заявил представитель Партии регионов Василий Горбаль, «глава Минтопливэнерго Юрий Продан, по сути, осуществляет содействие в «реприватизации» «Днипроэнерго». Безусловно, такие старания необходимо прекратить. Иначе чиновники повлияют на инвестиционный климат в государстве, создав Украине имидж государства, которое помогает рейдерам» (From.ua, 3 марта 2008 г.).
Лоббирует интересы корейских компаний, с помощью которых до 2030 года Украина построит 20 новых атомных реакторов. В 2009 году был подписан меморандум о взаимопонимании относительно сотрудничества по проекту ядерной энергетики в Украине между государственным предприятием «Энергоатом» и корейской электроэнергетической компанией «КЕРСО».
«В перспективе Украина в рамках своей энергетической стратегии до 2030 года должна построить около 20 новых атомных энергоблоков. Поэтому сотрудничество с корейской компанией в сфере ядерной энергетики для нас сегодня является приоритетным, и у нас есть надежда, что, развивая сотрудничество с Кореей, Украина получит возможность строительства корейских реакторов с использованием всей цепочки, от производства атомных реакторов до их эксплуатации», — сказал Продан.
Брат Юрия Продана — Петр имеет отношение к ЗАО «Институт проблем атомных станций».
Так, в 2008 году, став главой Минтопэнерго, Юрий Продан заинтересовался атомным бизнесом. 22 января его брат Петр стал генеральным директором ЗАО «Институт проблем атомных станций» (ИПАС, г. Одесса). Теперь данное предприятие, специализирующееся на производстве спецтехники для атомной энергетики, может стать одним из самых востребованных на своем рынке, сообщала «ДеПо.Ua».