В 1840 году другой Башир, участник восстания ливанцев против Ибрагим-паши, когда тот пытался их разоружить и задавить поборами, который помог османам и британцам его изгнать, был назначен губернатором Ливана. Османы, проводившие политику централизации, начатую реформатором Махмудом, теперь более чем когда-либо были убеждены, что единственный способ удержать Горный Ливан под контролем – это посеять семена раздора и разжечь вражду между местными христианами и друзами. До той поры, как отмечалось выше, расстановка сил в горах проходила поперек деноминаций и выстраивала кайситов против йеменитов или Язбаков против Джанбалатов. Посеянная таким образом междоусобица между христианами и друзами началась в 1841 году и завершилась резней 1860 года, которая заставила вмешаться европейцев. Французская армия около года оккупировала Ливан. По некоторым оценкам, число христиан, убитых в 1860 году, составило 11 тысяч человек, а еще 4 тысячи погибло от лишений.
Согласно органическому статуту 1861 года, пересмотренному в 1864 году, Горный Ливан получал автономное правительство во главе с генерал-губернатором (мутасарриф), христианином-католиком, который назначался Портой и одобрялся державами-подписантами. Этот глава назначался на пятилетний срок, который мог продлеваться, и правил при содействии выборного административного совета из двенадцати представителей различных религиозных общин. Подчиненные ему наместники (ед. ч. каймакам) управляли семью округами, на которые разделили новую провинцию мутасаррифат Джебель-Лубнан, исключив из нее Бейрут, Сидон, Вади-ат-Тайм и Бекаа. Правительство обладало собственной судебной системой и охраняло порядок при помощи местного ополчения. В провинции не расквартировывались турецкие войска, она не отправляла даль в Константинополь, и ее граждане не призывались на военную службу.
Этот автономный Горный Ливан, хотя и лишенный некоторых стратегических районов в пределах его естественных границ, вступил в эпоху относительного спокойствия и процветания, вряд ли достижимых в любой другой провинции империи. Появились новые дороги, высокогорные деревни превратились в летние курорты, узкоколейная железная дорога соединила Бейрут с Дамаском. Постепенно шло преодоление преград, мешавших его народу на протяжении многих веков, трудностей внутреннего сообщения, отчасти объяснявших политическую неспособность сформировать единое государство. Летние курорты извлекали пользу из красоты природы, которой щедро одарены горы. Скудность природных ресурсов частично компенсировалась возможностями для внешней торговли, а бедность почвы побуждала его сыновей, как и их далеких предков, становиться торговцами и осваивать Левант. В те времена бытовала поговорка: «Повезло тому, у кого в Ливане есть хоть козий загон». Рост благосостояния отразился в перенаселении, особенно среди христиан, которые искали выхода из трудного положения через эмиграцию. Плодовитость местных женщин резко контрастировала с бесплодием почвы. Начиная с 80-х годов XIX века ливанские эмигранты искали новые пристанища для себя и своих семей в Египте, Америке, Австралии и других частях цивилизованного мира. По разным оценкам, только в Соединенных Штатах проживает не менее четверти миллиона выходцев из Ливана.
Ряд мутасаррифов начался с одного необычайно одаренного человека – Дауд-паши, который стремился вернуть Ливану часть утраченной территории, основал для друзов школу в Абайе, до сих пор носящую его имя, и боролся с феодалами на юге и клерикалами на севере. Вторыми руководил Юсеф Карам, который после нескольких военных столкновений был сослан в Италию, где и умер. Второй преемник Дауда Рустем-паша, впоследствии посол в Лондоне, был столь же твердым и рачительным управителем. Привилегии, которыми пользовался Ливан, Турция отменила в годы Первой мировой войны. Его устав послужил образцом для Крита и в целом оказался «наиболее успешным примером автономии среди турецких провинций».