Переговоры были прерваны смертью короля Стефана Батория – в декабре 1586 года. В Речи Посполитой началась междоусобная борьба за трон. Претендентов было трое – австрийский эрцгерцог Максимилиан, шведский король Сигизмунд III Ваза и московский царь Федор Иванович. Подканцлер Лев Сапега предложил план федерации Великого княжества Литовского, Польши и Московского царства. Стороны обменялись грамотами и в апреле 1587 года в Москву прибыло посольство Великого княжества Литовского, чтобы продолжить переговоры и обговорить условия унии. Московского царя пригласили на выборный сейм в Варшаву, но Федор Иванович не поехал, послал своих представителей. Московских послов назначали не по уму и профессионализму, а по близости к царю. Несмотря на то, что в Речи Посполитой было много сторонников Федора Иоанновича, надменность и бестолковость московских послов провалили намечавшийся союз и федерацию Речи Посполитой и Московского царства. Уникальный исторический шанс объединения двух славянских государств был полностью потерян осенью 1587 года. Письмо «Панов-рады» в Москву 1587 года дошло до нашего времени:
«Мы все – литвины и большая часть поляков хотим господина вашего. Но задержка только за верой и приездом. Если бы знали о скором приезде государя вашего, мы бы, избравши его, в тот же час пошли на Краков и не дали бы короны ни шведу, ни брату цесаря».
Царь не приезжал, не соглашался короноваться в Кракове, а только в Москве или Смоленске, не захотел в титуле писать первым «король литовско-польский», не согласился ни с одним из предложений Великого княжества Литовского и Польской Короны. В острой борьбе магнатских кланов королем Речи Посполитой был выбран швед Сигизмунд III Ваза. В декабре 1587 года на съезде элит Великого княжества Литовского в Бресте он был признан великим князем Литовским. Не получилось создать суперимперию в Европе и Азии.
Через месяц после признания Сигизмунда III великим князем Литовским Лев Сапега в Кракове подписал у него указ-привилей, который утвердил III Статут Великого княжества Литовского, Русского и Жамойтского, получивший юридическую силу. Статут 28 января 1588 года подчеркнул автономию Великого княжества Литовского в составе Речи Посполитой, называл польскую шляхту «соседями» и «чужеземцами» – полякам было запрещено получать в наследство и в награду за службу, а также покупать имения, поместья, земли, занимать должности в Великом княжестве Литовском.
Свод законов, а именно так можно назвать Статут, обеспечивал политическую, экономическую и культурную «особость» Великого княжества Литовского. Все внутренние дела княжества решались внутри него. Высшим законодательным органом являлся Общий – Вальный сейм, собиравшийся в Слониме. Статут вводил такие понятия, как государственный и национально культурный суверенитет, религиозную толерантность, презумпцию невиновности. Лев Сапега сам подготовил его к печати и уже летом 1588 года издал его в Виленской типографии. В предисловии Лев Иванович объявил цель издания этого свода законов – создание правового государства, гарантирующего защиту прав всем жителям Великого княжества Литовского.
Сам Статут несколько лет создавала специальная комиссия, в которую входили представители разных конфессий и слоев населения. Статьи и разделы Статута обсуждались на поветовых собраниях – сеймиках. Лев Сапега писал: «Правовое устройство есть цель и конец всех прав на свете, им все государства стоят и в целости сохранены бывают». Статут утвердил, что власть должна подчиняться закону и единому для всех суду. Лев Сапега ввел ответственность шляхты за убийство крестьянина – этого в прежних законах не было. Вводился институт адвокатов, судьи были обязаны оправдывать людей, чья вина не была доказана. За преступление против женщины устанавливалась двойная ответственность. Под охрану государства попала и природа, вводился порядок пользования землей, водой, лесами. Статут подтверждал право Княжества чеканить свои деньги, оно могло не участвовать в боевых действиях и войнах, которые вела Польша. Первенство права, которому подчинялся король и великий князь, считалось «сокровищем в руках наших, которое ни за какие деньги нельзя купить». Статут 1588 года действовал в Великом княжестве Литовском двести пятьдесят лет.