Воздух к каждому двигателю подводится через автономный воздухозаборник. Регулирование площади сечения воздухозаборника и изменение углов установки его верхней плоскости на входе осуществляются изменением положения двухстворчатого регулируемого элемента-клина. Передняя створка клина имеет отверстия для отсоса пограничного слоя, а на задней створке установлен турбулизатор. В целях уменьшения потерь в воздушном канале внизу воздухозаборника установлен регулируемый элемент, называемый нижней створкой. Нижняя створка воздухозаборника может занимать три фиксированных положения.
Перед первой ступенью компрессора каждого двигателя установлен входной направляющий аппарат, представляющий собой тонкостенный цилиндр с направляющими лопатками. Направляющий аппарат улучшает помпажные характеристики двигателей.
Для предохранения конструкции самолета и агрегатов двигателей от перегрева отсеки силовой установки продуваются воздухом, поступающим из атмосферы.
Управление двигателями осуществляется двумя рычагами сектора газа, установленного в кабине пилота. Каждый двигатель имеет автономную систему управления, в том числе и противопожарной системой.
Топливо (основное типа Т-6, резервное типа Т-7П) на самолете МиГ-25 размещается в шести фюзеляжных баках и четырех крыльевых.
Разведчики, выпущенные до середины 70-х годов, имели два дополнительных бака в килях. Крыльевые баки являются частью конструкции крыла. Они расположены вдоль размаха крыла попарно (передний и задний) на каждой консоли. Фюзеляжные баки составляют цельносварной, неразъемный баковый отсек фюзеляжа. Все фюзеляжные баки имеют сложную форму.
Запас топлива на перехватчиках составляет 14570 кг, на разведчиках – 15245 кг. Под фюзеляжем самолета может подвешиваться дополнительный бак емкостью 5300 л (4370 кг). При этом общий вес топлива на перехватчике МиГ-25ПД увеличивается до 18940 кг, на разведчике – до 19615 кг. На перехватчиках ранних выпусков до МиГ-25ПД и доработанных в строю МиГ-25ПДС подвесной бак не устанавливается. На модификациях МиГ-25ПД и ПДС для увеличения рубежа перехвата подвесной бак может, устанавливаться в перегрузку.
Вооружение. Вооружение перехватчиков МиГ-25П состоит из четырех ракет средней дальности Р-40 (изделие «46») с различными системами наведения, двух ракет Р-40Р с радиолокационной головкой наведения и двух ракет Р-40Т с тепловой головкой самонаведения. Ракеты подвешиваются на пилонах под консолями крыла (попарно с каждого борта). Пилоны снабжены пусковыми устройствами АПУ-84-46 (автоматическое пусковое устройство для самолета «84» под ракеты «46»). Модернизированные перехватчики МиГ-25ПД и МиГ-25ПБС вооружены усовершенствованными ракетами типа Р-40РД и Р-40ТД. На внешних пилонах доработанных перехватчиков вместо ракет Р-40ТД могут на спаренных пусковых устройствах устанавливаться по две ракеты ближнего боя – Р-60 или Р-60М. В этом случае на внутренних пилонах устанавливаются только ракеты Р-40РД.
Максимальная боевая нагрузка разведывательно-бомбардировочных вариантов (МиГ-25РБ, РБК, РБС, РБВ, РБШ, РБФ) составляет 4000 кг, а самолета N° 02022077 – 5000 кг. Бомбы подвешиваются на четырех балочных держателях МБД 3-У2 с замками ДЗУ-1 (при тандемной подвеске бомб используются держатели МБД 3-У2Т). Два балочных держателя устанавливаются под крылом (в местах крепления внутренних пилонов перехватчика) и два – под фюзеляжем по оси симметрии самолета. Варианты подвесок бомб следующие:
4 осветительные бомбы ФОТАБ-100-80 (попарно на держателях под крылом);
8 осветительных бомб ФОТАБ-100-80 (попарно на держателях под крылом и под фюзеляжем);
8 бомб ФАБ-500М-62 (попарно на держателях под крылом и попарно на одном держателе под фюзеляжем с тандемной подвеской);
8 бомб ФАБ-500М-62 (попарно на держателях под крылом с тандемной подвеской и попарно на одном держателе под фюзеляжем с тандемной подвеской);
10 бомб ФАБ-500М-62 (попарно на держателях под крылом с тандемной подвеской и на двух держателях под фюзеляжем с тандемно-попарной подвеской);
10 бомб ФАБ-500М-62 (попарно-тандемная подвеска под крылом и попарно-строенная подвеска на одном держателе под фюзеляжем).
