Рули поворота клепаной конструкции, навешены на кили в трех точках. В нижней точке навески имеется рычаг, к которому подсоединяется тяга управления рулем. Рули отклоняются на угол ±25°.
Горизонтальное оперение свободнонесущее. Стабилизатор цельноповоротный. В 1973 г. ось вращения плоскостей перенесли вперед примерно на 140 мм для устранения явления перекомпенсации на режиме «ножницы».
Стабилизатор состоит из двух половин – левой и правой. Угол стреловидности по передней кромке 50°22'. Каждая половина стабилизатора крепится на балке в хвостовой части фюзеляжа в двух точках. Размах горизонтального оперения 8,8 м.
Ось вращения стабилизатора расположена на 33% средней аэродинамической хорды. Каждая половина стабилизатора имеет в задней части отогнутый на 2° хвостовой «нож». Угол отклонения стабилизатора при взлете и посадке от -32° до +13°, при максимальной скорости от -12,5° до +5°.
В хвостовой части самолета кроме оперения симметрично установлены два аэродинамических гребня клепаной конструкции. Гребни состоят из двух частей, соединенных с помощью болтов и гаек. Передняя часть гребня откидывается на петле, приклепанной к фюзеляжу. Задняя часть крепится к фюзеляжу двумя болтами и приклепывается к профилям заклепками. Низ передней части гребня съемный, выполнен из радиопрозрачного материала. В левом подфюзеляжном гребне расположен механизм выпуска тормозного парашюта (штанга – датчик момента касания земли).
Шасси. Шасси трехопорное, убирающееся в полете. Передняя стойка рычажного типа со спаренными управляемыми колесами. Главные стойки рычажного типа с консольным креплением одного колеса. После взлета стойки шасси убираются в отсеки фюзеляжа, поворачиваясь вперед в направлении полета. На каждой главной стойке шасси установлено по одному колесу КТ-111-2А или КТ-111А (колеса взаимозаменяемы) с размером шины 1300 ж 360, на передней стойке установлены два спаренных колеса КТ-112/2 или КТ-112А с размером шин 700 х 200.
Все колеса оборудованы инерционными датчиками автоматического растормаживания колес при появлении юза. На передней стойке установлен механизм разворота колес с двухступенчатым приводом – для поворота колес на малые и большие углы.
Уборка и выпуск всех стоек шасси производятся от общей гидросистемы, их выпуск может производиться от аварийной воздушной системы.
В выпущенном положении все три стойки удерживаются механическими замками выпущенного положения, передняя, кроме того, гидрозамком, запирающим гидросмесь в цилиндре. В убранном положении все стойки удерживаются механическими замками убранного положения. В полете ниши, в которых размещаются стойки шасси, закрываются щитками.
Силовая установка. На самолетах МиГ-25 ранних выпусков устанавливались два турбореактивных двигателя Р15Б-300 (изделие «15Б»), позднее двигатели Р15БД-300, отличающиеся конструкцией коробки приводов. Двигатели одновальные, с осевым компрессором, индивидуальными камерами сгорания в общем корпусе, одноступенчатой турбиной, форсажной камерой сгорания и двухстворчатым трехпозиционным эжекторным соплом. Максимальная тяга каждого двигателя 11 200 кг.
Двигатели установлены в отсеках фюзеляжа за шпангоутом № 9. Отсеки разделены между собой герметичной продольной перегородкой. Для улучшения эксплуатации двигатели развернуты относительно продольных осей на 13° так, что коробки агрегатов, расположенные в их нижней части, разведены во внешние стороны.
Реактивные сопла установлены на двигателях в вертикальной плоскости под углом 2°30’ вверх и в горизонтальной плоскости в сторону оси симметрии самолета под углом 1°46’. Такая установка сопл вызвана аэродинамическими расчетами.
Для уменьшения миделя хвостовой части фюзеляжа реактивные сопла сближены настолько, что расстояние между их центрами меньше диаметра сопла. В связи с этим у каждого сопла снято по три сегмента внешних створок, а чтобы сохранить контуры створок замкнутыми, между ними установлен нерегулируемый элемент – стекатель, на который и замыкаются внешние створки сопл двигателей.
Каждый двигатель закреплен в фюзеляже в двух плоскостях – в плоскости шпангоута № 10 (переднее крепление) и в плоскости шпангоута № 11 (заднее крепление).