К-129 находилась на ровном киле и без видимых повреждений. Вероятно, подводная лодка, получив сначала какое-то внешнее повреждение, заполнялась водой отсек за отсеком, и тонула относительно медленно, и давление внутри подводной лодки постоянно сравнивалось с внешним. Российские эксперты склонны считать, что именно так и случилось, а при подъеме подводной лодки переломилась именно в месте пробоины. Также считается, что ЦРУ умышленно прибегало к дезинформации, дабы скрыть подлинную картину. По утверждению К.Барлисона, К-129 на глубине развалилась, причем ВМС и ЦРУ США с самого нала знали об этом, и подводную лодку собирались поднимать по частям. В противном случае трудно объяснить, почему «Лунный бассейн» на «Glomar Explorer» имел длину чуть более 60 метров, тогда как длина К-129 составляет почти 100 метров. Из-за огласки операции в 1975 году от второго и третьего этапов ЦРУ пришлось отказаться. Возникает вопрос: почему ЦРУ решило поднимать в первую очередь не самую ценную в разведывательной информации среднюю часть подводной лодки, где были ракеты с ядерными боеголовками, шифры, секретные приборы и судовые документы, а сравнительно малоинтересную в этом плане носовую? Ответа нет, если не принять во внимание неоднократные сообщения в американских средствах массовой информации о том, что в ходе операции «Dgenifer» подняли все части подводной лодки, а сообщили лишь о носовой, где были найдены тела шести советских подводников, которых перезахоронили почти через два месяца в Тихом океане, в 90 милях к юго-западу от Гавайских островов. В октябре 1992 года ЦРУ передало президенту РФ видеопленку, на которой была запечатлена процедура захоронения подводников. По погибшим отслужили молебен на английском и русских языках, были исполнены гимны двух стран, а затем контейнер с останками подводников по морскому обычаю опустили в океан на глубину около 4 000 метров.
Версий гибели К-129 выдвинуто и существует до сих пор несколько. Правительственная комиссия рассматривала многие возможные причины гибели подводной лодки, среди них – взрыв боезапаса или аккумуляторной батареи, большое поступление воды внутрь прочного корпуса из-за несовершенства устройства подачи воздуха к дизелям, работающим в перископном положении или частично через пробоину, образовавшуюся в результате столкновения с другой подводной лодкой или кораблем.
Согласно версии, распространенной в США, советскую подводную лодку, находившуюся на Боевом патрулировании, в феврале-марте 1968 года отслеживала американская стационарная высокочувствительная система дальнего гидроакустического обнаружения «Морской паук». Она же и засекла момент и место катастрофы. Как сообщила американская печать, первой к лежащей на дне советской подводной лодке, подошла атомная подводная лодка США «Halibat», переоборудованная из атомной с крылатыми ракетами в разведывательную – специально для участия в операциях по слежению за советскими подводными лодками и кораблями.
Летом 1968 года «Halibat» изучила корпус затонувшей советской подводной лодки: спущенная по кабель – тросу фотокамера сделала тысячи снимков К-129.
8-12 марта 1968 года подводная лодка К-129 погибла в Тихом океане со всей командой по неизвестной причине при несении Боевой службы.
30 июля 1968 года исключена из состава ВМФ. В конце 1992 года о погибших подводниках впервые было сказано открыто. ГК ВМФ приказал подготовить проекты нового приказа Министра обороны и постановления Правительства относительно К-129.
Указом Президента Российской Федерации от 20 октября 1998 года №-1285, по происшествии тридцати лет с момента гибели, команда подводной лодки К-129 был посмертно награжден орденами Мужества. Но вопрос о причине трагедии и месте погребения моряков по-прежнему остается без ответа, хотя из военного и политического давно стал нравственным.
Тактико-Технические Данные подводной лодки К-129:
Водоизмещение: надводное/подводное – 2300/2820 тонн. Главные размерения: длина наибольшая (по КВЛ) – 98.9 метра, ширина корпуса (наибольшая) – 8.2 метра, средняя осадка (по КВЛ) – 8 метров. Скорость: надводная/подводная – 14/12 узлов. Силовая установка: три дизеля 37Д по 2 000 л.с., один электромотор ПГ102 – 2 700 л.с., два электромотора ПГ101 по 1350 л.с. Вооружение: четыре носовых и два кормовых 533-мм торпедных аппарата. Ракетный комплекс Д4, три баллистические ракеты Р21 в ограждении рубки. Предельная глубина погружения: 300 метров. Автономность плавания: 70 суток. Команда: 89 подводников.