Пачелли откладывал подписание конкордата, чем, как утверждает в своей книге «Церкви и Третий рейх» историк Клаус Шольдер, «и создал ту фатальную точку опоры, оттолкнувшись от которой Адольф Гитлер в 1933 году всего за две недели заставил германских католиков капитулировать».
Иными словами, Эудженио Пачелли, будучи нунцием в Берлине, мог добиться подписания конкордата в начале двадцатых годов, не компрометируя при этом политических действий германских католиков. А в начале тридцатых годов было уже слишком поздно: Гитлер усмотрел в подписании конкордата с государством Ватикан возможность освободить политическую арену от немецких католиков и католических центристских партий. По мнению политических аналитиков и историков, Пачелли подыграл Гитлеру, помог ему избавиться от неудобных и многочисленных католических группировок. Адольф Гитлер не желал конфронтации с Пачелли, ни когда тот пребывал в ранге нунция Ватикана, ни тем более тогда, когда он стал римским папой.
Еще одно дело, с которым пришлось разбираться Священному Альянсу и, в качестве папского нунция, Эудженио Пачелли, имело место в 1920 году. Конфликт возник между Германией и Францией из-за того, что Франция в качестве оккупационных войск использовала на территории Рейнской провинции африканские полки. Пачелли получал от членов католических общин множество жалоб на бесчисленные случаи изнасилования служившими во французской армии солдатами-африканцами женщин и детей католического вероисповедания. Кардинал Адольф Бертрам 31 декабря написал государственному секретарю кардиналу Пьетро Гаспарри письмо, в котором утверждал, что «Франция предпочитает использовать африканских солдат, которые, ввиду их дикости и отсутствия у них какого бы то ни было воспитания и представления о морали, беспрестанно нападают на местных женщин и детей, так что дело дошло до состояния, которое называют «черным позором». А французы, несмотря на протесты Германии, планировали послать дополнительные африканские части в этот регион. Пачелли стал просить Гаспарри дать соответствующие инструкции Священному Альянсу, чтобы он вмешался в это дело.
Французский посол отвергал протесты Эудженио Пачелли и кардинала Адольфа Бертрама, классифицируя их как антифранцузскую пропаганду. Не подлежит, однако, сомнению, что виновными в этом деле были солдаты и офицеры полков, сформированных из аборигенов стран Северной Африки и французских колоний в Северной Сахаре.
Священный Альянс решил послать в Рейнскую провинцию следователей для взятия показаний у пострадавших. Папские агенты обнаружили, что женщины и дети и Рейнской провинции подвергались со стороны французских солдат самым изощренным издевательствам. Маленьких, не старше десяти лет, мальчиков похищали и насиловали; девочек-подростков похищали, истязали и превращали в сексуальных рабынь; женщин били и насиловали; все это происходило непрерывно.
Агенты Священного Альянса представили свои доклады не только в Рим, папе Бенедикту XV, но и нунцию Пачелли. Между тем один случай еще более накалил и без того тяжелую обстановку. Три солдата и два офицера африканских полков похитили одиинадцатилетнюю девочку по имени Нина Хольбех. Через два дня тело девочки нашли привязанным к балке в заброшенной конюшне. Нину истязали и садистски насиловали, пока она не умерла. Германия потребовала правосудия, но побежденный народ, народ страны, развязавшей мировую войну, не имел на него права. Тем не менее Пачелли решил дать правосудие этому народу.
Ответом папской агентуры был поток разоблачений в Соединенных Штатах и Великобритании позиции Франции по отношению к насилию, чинимому солдатами, принадлежащими к ее африканским полкам, над белыми женщинами и девочками на территории Рейнской провинции. В результате давления папской агентуры на Вашингтон Конгресс принял решение послать в Германию следственную комиссию. Пачелли надеялся, что американское правительство окажет давление на Париж с тем, чтобы французские власти прекратили насилие над женщинами и детьми. Но произошло нечто совершенно иное. Правительство Вудро Вильсона рекомендовало Комитету Конгресса не принимать никаких мер против Франции на основании жалоб, которые поступали из Германии и от Святого престола.