В 1906 году Умберто Бениньи оказался в самом сердце Ватикана: он был назначен помощником государственного секретаря по иностранным делам в Государственном секретариате.
Не имея абсолютно никакого опыта в вопросах дипломатии, Бениньи занялся тем, что стал заводить связи, которые могли быть полезны ему в продвижении по служебной лестнице в Римской курии. Государственный секретарь кардинал Мерри дель Валь имел двух секретарей: по экстраординарным делам (этот секретарь курировал вопросы отношений с другими государствами) и по ординарным вопросам (в ведении этого секретаря находились административные дела Ватикана). Бениньи находился в распоряжении монсеньора Пьетро Гаспарри, который был переведен на эту должность из директората Ватиканской семинарии — именно там Гаспарри познакомился с Бениньи, которого считал очень деятельным и эффективным работником.
Когда освободился пост нунция на Кубе, Гаспарри предложил его Умберто Бениньи, но тот устремлял свои взгляды гораздо выше, не более не менее как в сторону Государственного секретариата. Совсем недавно Бениньи было отказано в должности руководителя Конгрегации Пропаганды Веры.
В то время должность государственного секретаря по экстраординарным делам была очень важной. Но при всем при том Пьетро Гаспарри, как ни странно, поручили отредактировать и опубликовать новый Кодекс Канонического Права — дело, которое требовало немалого времени и внимания. И поскольку Гаспарри был так занят, главным помощником кардинала Мерри дель Валя сделался Бениньи. Никому не известный священник и журналист, который когда-то приехал в Рим в поисках счастья, мог теперь достаточно свободно передвигаться по коридорам власти. Новый помощник государственного секретаря устроил свой кабинет в апостольском дворце, чтобы находиться поближе к государственному секретарю и всего лишь в четырех дверях от кабинета самого понтифика.
В 1909 году монсеньор Умберто Бениньи по приказанию кардинала Мерри дель Валя создал агентурную сеть, задачей которой было выявление в пределах Ватикана и церковных учреждений лиц, высказывавшихся в пользу неизбежности модернизма. Очень скоро от шпиков Бениньи стали поступать доносы на священников, работавших в университетах, средствах массовой информации и политических институтах Франции, Великобритания. Германии и Италии. Следствием составленных людьми Бениньи доносов, которые так или иначе касались почти трехсот служителей церкви, явилось то, что государственный секретарь кардинал Мерри дель Валь, испытывавший органическое отвращение к политическим и религиозным нововведениям, отдал своим подчиненным распоряжение организовать особую структуру, некое подобие контрразведки, которая должна была действовать только в пределах Ватикана и других учреждений церкви. Внешняя разведка продолжала оставаться в ведении Священного Альянса. Эта новая контрразведывательная структура должна была называться Sodalitium Pianum (Ассоциация Пия) и обозначаться в стенах Ватикана буквами S.P.
Первым долгом Sodalitium Pianum должна была создать логически правильную программу достоверной пропаганды, которая дала бы возможность убедительно опровергать аргументы модернистов и выигрывать будущие открытые дебаты, как внутри церкви, так и в обществе в целом. С другой стороны, задачей S.P. была тайная вербовка в Европе и Северной и Южной Америке агентов, которые должны были узнавать, кто является модернистом, раскрывать окружения и связи этих людей и ломать их планы. Умберто Бениньи взялся за дело со всей остервенелостью фанатика. Очень скоро вместо обязанностей помощника секретаря по экстраординарным делам он стал исполнять другие, связанные со слежкой и шпионажем. Эти обязанности должны были оставаться тайной даже для его сотрудников по Государственному секретариату, включая его начальника, монсеньора Пьетро Гаспарри.
Бениньи знал, какой силой воздействия на умы обладает пресса, и был искренне убежден, что Ватикан должен как можно лучше использовать газеты для борьбы с модернизмом и либерализмом. Глава S.P. назначил сам себя чем-то вроде руководителя неофициальной пресс-службы Государственного секретариата и много лет внушал журналистам, которые писали на связанные с римским папством темы, какой линии им следует придерживаться в своих статьях. Корреспондентов тех газет и агентств новостей, которые придерживались либеральной идеологии, Бениньи рассматривал как врагов. Консервативные средства массовой информации он считал друзьями.
