Иван III, узнав об измене, двинул на Новгород московские полки и полки, подчиненных Москве земель. 13 июля 1471 года новгородское ополчение было разбито. Дмитрий, сын Марфы Борецкой, попал в плен и был казнен (второй сын, Федор, был в 1476 г. сослан в Муром. Сама Марфа была казнена в 1488 г.). Литва на помощь не пришла. Новгород сохранил самостоятельность, но отказался от союза с Литвой, уплатил огромную контрибуцию и признал верховную судебную власть московского князя.
В 1475 г. Иван III по просьбе младших граждан приехал в Новгород на суд. Простой люд, увидев правый суд великого князя над виновными, в том числе и знатными боярами, стал искать правосудия в Москве. В 1477 г. два представителя новгородского веча в своей челобитной назвали Ивана III и его сына государями, тем самым, признавая их власть над Великим Новгородом. Новгородцы отказались от слов своих сограждан. Обвинив Новгород во лжи и клятвопреступлении, Иван III выступил против него в поход. В середине января 1478 года Новгород признал власть великого князя и был приведен к присяге. Новгородская олигархическая республика была ликвидирована, а вечевой колокол, символ независимости, свезен в Москву.
Осенью 1479 года Ивану III донесли, что Новгород вновь пересылается с Казимиром IV и зовет его к себе, король обещает освободить город от власти великого князя и приглашает большеордынского хана Ахмата (Хан в 1465–1481 гг.) к совместному нападению на Москву. В это же время против великого князя составили заговор его родные братья — Андрей Большой Горяй (Кн. Углицкий и Звенигородский в 1462–1492 гг.) и Борис (Кн. Волоцкий в 1462–1494 гг.). Младший брат Андрей Меньшой (Кн. Вологодский в 1462–1481 гг.) всегда поддерживал старшего брата. Черная кошка пробежала между братьями после смерти брата Юрия (Кн. Дмитровский в 1462–1473 гг.), когда Иван III взял себе весь его удел, ничего не выделив братьям. В 1478 г. братья участвовали в покорении Великого Новгорода, но опять положенную им согласно традиции долю в новгородских землях не получили. Кроме того, в 1479 г. Иван III лишил братьев права удельных князей принимать к себе отъехавших бояр. Свои семьи братья отправили к Казимиру, а сами уехали на границу с Литвой в Великие Луки.
Новгородцы, уверовав в помощь Литвы, прогнали наместников великого князя и избрали посадника и тысяцкого. Иван III в третий раз осадил мятежный город. Новгородцы опять не получили помощи от Литвы и сами не имея достаточно сил для обороны, впустили великого князя в город. Главные зачинщики мятежа (около 150 человек) были арестованы и казнены. Более восьми тысяч семей было переселено на земли Московского княжества.
Хан Ахмат, хорошо осведомленный о мятеже братьев великого князя, о войне с Великим Новгородом, договорился действовать совместно с Казимиром. В 1480 г. Ахмат повел на Москву стотысячное войско. Иван III пошел братьям на уступки и заключил с ними мир.
За "стояние на Угре" современники обвиняли Ивана III в малодушии и трусости. Дмитрий Донской объединил часть русских князей и разгромил Мамая, но не смог защитить страну от Тохтамыша, т. к. слишком велики были потери на поле Куликовом. Обескровленная Русь вновь стала данником орды. Положение Ивана III Васильевича было намного труднее. С Юга напала Большая орда. С Запада готовилась напасть Литва. На Северо–Западе Псков отражал очередное нападение Ливонского ордена. На Севере Великий Новгород, где, опасаясь мятежа, великий князь держал большое войско. На Востоке Казанское ханство, где к власти в 1479 г. пришел ставленник Ногайской орды хан Али. В самой Москве готовые к измене родные братья. Да, тяжела она, шапка Мономаха!
Хан Ахмат убоялся принять генеральное сражение. Время единства и могущества Золотой орды прошло. Нападение крымского хана Менгли–Гирея на литовскую Украину, заставило Казимира забыть о его нападении на Москву. Нур–Даулат–Гирей в составе русского отряда участвовал в разорении Сарая, столицы Большой орды. Хан Ахмат ушел с Угры, разграбив земли лживого союзника, так и не выступившего против Москвы, вернулся в родные степи, был схвачен ногайскими князьями и убит.
