В результате в первый же день войны Северо-Западный фронт оказался расчлененным по линии разграничения 8-й и 11-й армий. 25 июня Ставка потребовала организовать новый фронт обороны по рубежу реки Западная Двина. Что же касается противника (Группа армий «Север» — 18-я полевая армия, 4-я танковая группа, 16-я полевая армия), то с выходом своих войск на рубеж Западной Двины он взял оперативную паузу. С этого момента приграничное сражение в Прибалтике закончилось.
26 июня 1941 года командующий войсками Северо-Западного фронта генерал Кузнецов докладывал в Москву: «… 1. Противник продолжает окружение Либава.
2. 8-я армия — 12-й механизированный корпус и 5-я танковая дивизия в тылу противника без горючего. Командир 3-го механизированного корпуса донес открыто 25.6.41 г.: “Помогите, окружен”. Стрелковые соединения на фронте Плателяй, Кражай, Кемле, Шиауленай, Шедува. В ночь на 27 июня начнет отход р. Лиелупе и далее на северный берег Зап. Двина до Екабпилс. Соединения армии понесли потери и нуждаются в их немедленном пополнении, которое начало по мобилизации поступать, но не может быть одето, так как обмундирование двух стрелковых дивизий осталось в бывших пунктах дислокации.
Соединения потеряли часть оружия, что уточняется.
11-я армия — штаб и Военный совет армии, по ряду данных, пленен или погиб. Немцы захватили шифрдокумент. 5, 33, 188, 128-я стрелковые дивизии неизвестно в каком состоянии и где находятся. Много отставших и убежавших, задерживаемых направлении Двинск. Много брошено оружия. 11-я армия не является организованным боеспособным соединением.
На вильнюсском направлении необходимо развертывание новой армейской группировки немедленно. За счет пополнения, видимо, погибших дивизий, прошу разрешить формирование новых четырех стрелковых дивизий…»
Согласно данным «Книги потерь», Прибалтийская стратегическая оборонительная операция проводилась в период с 22 июня по 9 июля 1941 года: «…войсками Северо-Западного фронта и частью сил Балтийского флота. В ходе боевых действий в состав советских войск дополнительно введены четырнадцать дивизий и одна бригада. В рамках данной операции проведены: приграничное оборонительное сражение и фронтовой контрудар на шяуляйском направлении.
Продолжительность — 18 суток. Ширина фронта боевых действий — 350–450 км. Глубина отхода советских войск — 400–450 км. <…>
Наступавшая в Прибалтике группа армий “Север” (командующий фельдмаршал В. Лееб) состояла их 16-й и 18-й полевых армий и 4-й танковой группы. Вместе с 3-й танковой группой ее передовые силы вторжения насчитывали 655 тыс. чел., 7673 орудия и миномета, 1389 танков и 1070 самолетов 1-го воздушного флота…
Оборонялся Северо-Западный фронт… преобразованный из Прибалтийского Особого военного округа. Он имел в своем составе 8-ю, 11-ю и 27-ю армии, а также 5-й воздушно-десантный корпус. Общая численность войск фронта, без учета части сил Балтийского флота, составляла около 440 тыс. чел., около 5 тыс. орудий и минометов, 1274 танка и 1078 самолетов. <…>
В начале первого дня войны противник выбросил диверсионные группы, бомбил аэродромы, внезапной атакой захватил целыми все мосты через Неман. Части 8-й и 11-й армий не смогли удержать линию фронта. Танковая группа генерала Гота, прорвав оборону 11-й армии, устремилась на Вильнюс, а 4-я танковая группа генерала Гепнера, смяв боевые порядки 8-й армии, быстро продвигалась к Даугавпилсу.
Пытаясь остановить рвущегося к Вильнюсу врага, командующий 11-й армией генерал-лейтенант В.И. Морозов бросил в бой 3-й мехкорпус, однако в ожесточенном сражении вечером 22 июня 5-я дивизия корпуса была разгромлена и отступила. 24 июня Вильнюс пал, а танки Гота рванулись к Минску.
23 июня командующий фронтом Ф.И. Кузнецов попытался организовать контрудар силами 3-го и 12-го мехкорпусов против 4-й танковой группы противника. Хотя в целом советские войска имели полуторное превосходство в танках, они вдвое уступали в живой силе и артиллерии. Двухдневное ожесточенное танковое сражение из-за огромных потерь и нехватки боеприпасов пришлось прекратить. В 12-м мехкорпусе осталось всего 35 танков.