Только в 1922 г. появилась морская таможенная охрана, в 1925 г. — пограничная. Самой крупной боевой единицей военно- морского флота Польши до начала Второй мировой являлся минный заградитель «Гриф» водоизмещением 2250 т, вступивший в строй в 1938 г. К началу военных действий в составе польского флота числились 4 эсминца, 5 подводных лодок, 2 канонерские лодки, тральщики, транспорты и плавбазы, а также различные катера и вспомогательные суда. После начала войны судьба польского флота сложилась не слишком удачно — часть кораблей погибла в боях (уже 3 сентября 1939 г. немецкая авиация потопила эсминец «Вихер» и минный заградитель «Гриф»); ряд кораблей (три подводные лодки и катер) был интернирован в портах иностранных государств; некоторые корабли, по заранее намеченному плану, за два дня до нападения Германии, были отправлены в Англию и участвовали в войне под британским командованием и польским флагом. При этом польские офицеры и матросы сохранили свои звания, по отношению к ним применялись польские уставы.
Польские корабли на английской службе сумели проявить себя вполне боеспособными, отличившись в ряде боевых эпизодов. Кроме собственных кораблей, поляки в ходе войны получали от англичан новые боевые единицы. Всего под флагом Польши в течение войны находилось 47 боевых кораблей, в том числе 2 крейсера, 8 подводных лодок и 10 эсминцев. В ходе боевых действий польские корабли потопили семь надводных кораблей (предположительно девять) и 2 подводные лодки (предположительно пять). Сами поляки потеряли семь кораблей. Из офицерского состава по боевым и небоевым причинам погибло 69 человек. Польский флот был официально возрожден 7 июля 1945 г. после признания западными державами коалиционного правительства Осубки-Моравского — С. Миколайчика и прекращения руководства польским подпольем из зарубежья. Однако большинству русских морских офицеров, создававших этот флот и вынесших основную тяжесть войны, в нем места не нашлось…
Судьбы Польши, польского флота и, соответственно, русских эмигрантов, служивших в нем, сложились трагично в силу того, что они предопределялись решениями других держав — СССР и Германии. 23 августа 1939 г. в Москве был подписан печально знаменитый пакт Молотова — Риббентропа, спровоцировавший нападение Германии на Польшу, которое произошло 1 сентября этого же года. 17 сентября советские войска пересекли восточную границу Польши и заняли восточную часть страны, так называемые Западную Украину и Западную Белоруссию. К октябрю сопротивление польских вооруженных сил прекратилось, а Германия и СССР подписали договор о разделе Польши. На офицеров польских вооруженных сил, оказавшихся в зоне советской оккупации, обрушились репрессии.
Таким образом, в плену в Германии и СССР оказались польские офицеры польских вооруженных сил Одной из наиболее страшных страниц в истории польского офицерства является Катынь (Катынский лес) — урочище в 14 километрах к западу от Смоленска, где были убиты несколько тысяч польских офицеров. Споры о том, кто расстрелял офицеров, — советские или немецкие оккупационные власти — идут до сих пор. Среди жертв оказались и бывшие русские моряки.
По подсчетам современного историка флота Стрельбицкого, из тех, кто числился на действительной службе в составе ВМФ Польши, погибли 16 офицеров, окончивших российские военно-морские учебные заведения, а также 6 офицеров запаса польского флота, окончивших Морской корпус Кроме того, на территории Польши скончались восемь отставных офицеров флота, также окончивших морские учебные заведения в России. Известен ряд офицеров, состоявших на службе в польском флоте, начавших обучаться в российских морских учебных заведениях до Февральской революции 1917 г., но не закончивших обучение (их точное число не установлено). Из этих офицеров десять человек были расстреляны сотрудниками НКВД, 1 офицер — «… застрелен красноармейцем за ношение служебного оружия», 6 — расстреляны немцами либо умерли в немецком плену, 3 — погибли вместе со своими кораблями, 1 — погиб при бомбардировке и 1 — скончался в Англии