В III книге священномуч. Ириней опровергает гностиков, основываясь на Священном Писании и церковном предании.
В IV книге опровергаются воззрения Маркиона.
V книга посвящена эсхатологии.
Известны названия многих несохранившихся, или сохранившихся лишь в отрывках, сочинений священномуч. Иринея. Таковы: «Послание римскому епископу Виктору», «О схизме», «О единоначалии или о том, что Бог не есть виновник зла», «Книга разных рассуждений», «Об осмерице» (эонов), «Слово против эллинов о познании». «Книга разных рассуждений» является первым в истории христианской письменности сборником проповедей.
1. Священномуч. Ириней, хотя и включается традиционно в число апологетов, но по сути является одним из первых христианских писателей, у которого мы встречаемся с полным очертанием христианского богословия.
2. Гностики признавали Священное Писание за источник вероучения, но толковали его произвольно. Дабы противостоять им, священномуч. Ириней устанавливает «правило веры», то есть масштаб, определяющий во что нужно верить, и что следует отрицать как заблуждение. Под «правилом веры» священномуч. Ириней подразумевает Священное Писание и Священное Предание Православной Церкви.
3. Священномуч. Ириней указывает, что Евангелий – четыре, и что они сохраняются только в Церкви. Говорит он и о том, что истинная правая вера и истинное ведение (гнозис) о Боге возможно только в Церкви, которая получила веру и предание от апостолов.
Священномуч. Ириней доказывает, что Священное Писание истинно, потому что повсеместно и сохраняется в Церкви от апостолов, через преемство епископов.
4. Священномуч. Ириней отмечает, что епископы получают особый дар хранения истины. Гностики не имели епископата и поэтому они не могли представить доказательств истинности своего предания. Священномуч. Ириней доказывает, что их учение не от апостолов.
Говоря о церковной иерархии, священномуч. Ириней представляет иерархическое преемство от апостолов не как простое лишь восприятие иерархиею от апостолов богопреданного учения, а как таинственный акт благодати Божией, сообщающий избранному лицу дары Святого Духа.
5. Уча о Пресвятой Троице, священномуч. Ириней ясно говорит о совечности Богу Отцу Бога Сына и Бога Духа Святого. Это отличает учение священномуч. Иринея от неверного учения некоторых апологетов, по мысли которых, Логос, для отдельного существования, рождается непосредственно перед созданием мира.
6. Ценны Христология и учение о спасении в богословии священномуч. Иринея. Он защищает догмат Православной Церкви о единстве лица в Спасителе при двух природах. По его мысли, спасение человека должно было быть совершено не просто человеком, но Богочеловеком. «Ибо невозможно, чтобы человек, который раз был побежден и погиб через непослушание, сам воссоздал себя и получил награду за победу; также невозможно было, чтобы получил спасение тот, кто впал под власть греха; то и другое сделал Сын, Который есть Слово Божие, от Отца происходящее, Который воплотился и низшел даже до смерти, и совершил домостроительсто нашего спасения». Непослушание Адама в раю при древе было искуплено послушанием даже до смерти на крестном древе. «Слово Божие для того соделалось человеком и Сын Божий (единородный, Бог и Господь, Царь вечный и будущий Судия всех) – Сыном человеческим (бесславным... и низшедшим даже до смерти), чтобы человек, соединившись с Сыном Божиим и получив усыновление соделался сыном Божиим... Итак, Господь искупил нас Своею кровию и дал Свою душу за души наши и Свою плоть за плоти наши, и излил Духа Отца для воссоединения и общения Бога с человеком... даруя Своим пришествием нам нетление чрез общение с Богом» (кн. IV. Цит. по «Конспекту по патрологии», ч. I, Джорданвилль, 1993 г., стр. 26).
Необходимо отметить, что в приведенной выше цитате священномуч. Ириней богословски развивает учение об обо́жении, основание для которого имеется в Библии (см., например, Пс. 81). Впоследствии идею благодатного обо́жения человека развивали многие святые отцы (свят. Афанасий Великий, каппадокийцы и др.). Формула священномуч. Иринея Лионского , выражающая эту идею, такова: Сын Божий соделался Сыном человеческим, чтобы человек соделался сыном Божиим.
