III
Уничтожение самостоятельности Коряжемского монастыря произошло при следующих обстоятельствах. Преосвященный Самарский, когда началось дело об учреждении близ Самары монастыря, ходатайствовал пред Св. Синодом об упразднении одного из существующих монастырей в какой-либо епархии, где за множеством их можно сделать это без ущерба интересам благочестия. Св. Синод, указом от 19 сентября 1860 года, предписал Вологодскому епископу Христофору представить соображения о возможности закрытия какого-либо трехклассного монастыря, так как в Вологодской епархии многие монастыри от излишества оных при малочисленной братии находятся в крайне скудном состоянии. В октябре 1861 года епископ Христофор донес Св. Синоду, что из 18 мужских монастырей представляется возможным закрыть Коряжемский, так как он беден монашествующими (10 человек) и находится близко от Введенского трехклассного, в который и может быть переведена братия; при том же монастырь ни в историческом отношении, ни по внешнему устройству никакого особенного значения не имеет и находится в скудном состоянии; оклад Коряжемского монастыря был 417 руб. 60 коп. Вологодское епархиальное начальство полагало монастырь со всеми землями и угодьями приписать к Введенскому с тем, чтобы здания были поддерживаемы по возможности на доходы от угодий и на проценты со внесенных в пользу монастыря капиталов и чтобы Богослужение совершалось в нем впредь монашествующими Введенского монастыря. Св. Синод постановил, — перевесть штатный оклад Коряжемского монастыря на Самарский монастырь, так как без вреда интересам благочестия Коряжемский мог быть упразднен и приписан к Сольвычегодскому Введенскому. Этим последним управлял тогда казначей его иеромонах Феогност. В Введенский монастырь теперь был назначен настоятелем игумен Лопотова монастыря Виссарион. При сдаче Коряжемского монастыря оказалось денег: неокладной суммы 71 руб. 28 коп.; штатной — 351 руб. 79½ коп.; по документам — 7 билетов 4 % на 5858 руб. и свидетельство на имя бывшего строителя Платона на 758 руб. С 22 января 1864 года монастырь стал считаться закрытым.
Через 32 года, именно 13 апреля 1896 года, последовал указ Св. Синода о восстановлении Коряжемского монастыря самостоятельным с учреждением в нем общежития со строгим Саровским уставом.
Вологодское епархиальное начальство при выборе настоятеля Коряжемского монастыря остановилось на казначее Вологодского Спасо-Прилуцкого монастыря иеромонахе Нектарии (в мире Нестор Акиндинов). Уроженец деревни Клочкова, в трех верстах от Вологодской Заоникиевской пустыни, он с малых лет посещал эту обитель и, привыкнув к монастырским Заоникиевским порядкам, принял в этой пустыни в 1886 году пострижение; потом, по рукоположении в 1890 году во иеромонаха, вскоре назначен был в Спасо-Прилуцкий монастырь на должность казначея. В 1896 году за благочестную иноческую жизнь ему было 14 мая преподано от Св. Синода благословение с выдачею грамоты. Получив от 30 июля 1896 г. указ о назначении в Коряжемский монастырь, о. Нектарий, отвергшись своей воли, должен был принять трудное дело приведения запустевшей обители в благоустроенное состояние. Преосвященный владыка Вологодский Алексий, вняв прошению новоназначенного настоятеля, разрешил отправиться с о. Нектарием иеромонаху Заоникиевской пустыни Амфилохию, который подвизался в иночестве уже тридцать пять лет и был восприемником о. Нектария в монашестве, и еще одному послушнику для отправления клиросного чтения.
В конце 1901 года настоятель о. Нектарий указом Св. Синода переведен во Владимирскую Заоникиевскую пустынь, Вологодского уезда, на должность настоятеля. Вместо него указом Св. Синода от 13 марта 1902 года за № 1936, переведен настоятель Николаево-Прилуцкого монастыря игумен Павел. Игумен Павел был со времени возобновления обители вторым настоятелем. Получив домашнее образование, о. Павел, по увольнении из общества крестьян, Вологодской губернии, Грязовецкого уезда, Раменской волости, деревни Дресвид (в мире именовался Иван Яковлев Моисеев), был пострижен в монашество 9 октября 1880 года в Павло-Обнорском монастыре, Грязовецкого уезда, Вологодской губернии. В том же году был рукоположен в иеродиакона, а через год произведен в иеромонаха с назначением казначеем монастыря. Спустя шесть лет ему поручено было временно управление монастырем. В 1889 году о. Павел был утвержден казначеем монастыря и за усердную службу награжден набедренником. В следующем году ему было поручено замещать настоятеля Николаево-Прилуцкого монастыря. В 1896 году он был назначен благочинным монастырей Великоустюжского викариатства. В 1898 году он уже получил утверждение в должности настоятеля Николаево-Прилуцкого монастыря; в том же году преосвященнейшим Гавриилом епископом Великоустюжским при архиерейском служении возведен в сан игумена с вручением посоха. В следующем году игумен Павел награжден за усердную и полезную службу наперстным крестом. Спустя три года переведен настоятелем Коряжемского общежительного монастыря.