До определения нового настоятеля управление монастырем поручено было архимандриту Сольвычегодского городского Введенского монастыря Августину, только за полгода до этого времени переведенному туда из игуменов Корнильева Комельского монастыря. Августин (Марсов) скоро доложил епархиальному начальству, что в Коряжемском монастыре братии только: 1) белый священник Михаил Селянинов, более 90 лет от роду, 2) иеродиакон Виктор и два несовершеннолетних послушника; лица, самые ненадежные для охранения монастырского имущества; поэтому просил дозволить заведывать монастырем прежнему настоятелю иеромонаху Варлааму, по архиерейской резолюции оставленному в монастыре и не переселившемуся в Гледенский; он-де уже исправился. Епископ согласился на просьбу и снял с Варлаама запрещение священнослужения. В воздание за труды архимандриту Августину дозволено было брать одну половину игуменского по Коряжемскому монастырю жалованья, а другую половину обращать в пользу монастыря до назначения игумена. Так продолжалось до 9 июля 1828 года, когда в Коряжемский монастырь был переведен строитель Лальского монастыря Иероним[7] с производством во игумены.
Иероним управлял около 10 лет, до 23 марта 1837 года. Им произведен был ремонт обветшавших монастырских храмов, значительно умножена ризница, и за усердное попечение о монастыре ему была объявлена в 1832 году архипастырская признательность; так как Иероним был слабого здоровья и нередко болел, то в помощь ему в 1836 г. был дан священник Феодор Костылев, состоявший в Сольвычегодском Введенском монастыре на иеромонашеской вакансии, теперь назначенный в казначеи Коряжемского монастыря.
Но в марте следующего года Иероним по прошению был уволен преосвященным Стефаном от управления и помещен в число братии Успенской Семигородной пустыни, а в августе назначен был настоятелем иеромонах Мельхиседек (в мире Максим Кодратов Прокошев, сын дьячка Никол. Толшемской церкви[8]).
Он был настоятелем также, как и предшественник его, около 10 лет, до июня 1847.
В первые три года управления монастырем он обнаружил пред епархиальным начальством большую ревность к благоустройству монастыря, тщание и благоразумие; жизнь препровождал, по заявлению благочинного монастырей, честную, кроткую, добродетельную и во всем соответствующую уставам и правилам монашеским. Поэтому епископ Стефан «судил его достойным быть чина игуменского», в каковой его 20 марта 1840 года и произвел. Но через 7 лет, в 1847 году, в Волог. дух. Консистории слушалось дело о разных предосудительных поступках этого игумена и некоторых лиц из братии и 11 июня месяца этого года был назначен настоятелем Коряжемского монастыря строитель Лальского монастыря иеромонах Нафанаил.[9]
Он был переведен как способный содержать братию в пределах должной строгости, и поставлено ему в особенное внимание исправить между братством Коряжемского монастыря неустройства, допущенные при предшествующем игумене. В 1848 году 7 февраля — он уже получил благодарность епископа за отчетливые донесения касательно состояния монастыря и особенно братии, и внимательное наблюдение за каждым, из проживающих в обители. Вызванный 18 июня в архиерейский дом, он 30 июля определен был настоятелем Лопотова монастыря. А на место его определен управляющий Введенским монастырем иеромонах Платон, который был до 28 августа 1851 года. Преосвященный Евлампий, получив в марте месяце в 1849 году от него рапорт о состоянии монастыря, заметил: «Между братством Николаева Коряжемского монастыря, и старшим и младшим, есть немало больных (нравственно). Спросить управляющего монастырем, лечит ли он этих больных, и чем лечит их?» Нет сведений, чем лечил Нафанаил больных, а сохранились сведения, что им между прочим утрачено 15 монастырских икон, оцененных около 3 руб. 50 коп. каждая. Нафанаил получил сан игумена за управление Лопотовым монастырем и в 1851 году 5 мая был возвращен в Коряжемский монастырь. Здесь он повел управление весьма непорядочно, так что 6 июня 1851 года был назначен заведывать Коряжемским монастырем строитель Заоникиевской пустыни иеромонах Геннадий, который оставался до 20 марта 1852 г.; когда же по суждению Консистории Нафанаил был признан неблагонадежным настоятелем, то, для блага самой обители и монашествующих и для прекращения всех дел, непрестанно тянущихся по Консистории от непорядочного управления, уволен от должности настоятеля, с предоставлением ему на волю избрания монастыря для проживания, а в монастырь возвращен был в строители иеромонах Платон (с 17 марта 1852 г.). В 1863 году с 19 августа по 16 октября монастырем управлял казначей Сольвычегодского Введенского монастыря Феогност до прибытия строителя иеромонаха Фаллассия. Этот последний был родом из Орловской епархии, родной брат бывшего ректора Вологодской дух. семинарии архимандрита Ювеналия Знаменского. С 1859 года он был строителем в Заоникиевой пустыни. В Коряжемском монастыре он был до 4 января 1864 года. При нем монастырь был по указу Св. Синода от 26 ноября 1863 года упразднен и приписан к Сольвычегодскому Введенскому. Фаллассия перевели в Лопотов монастырь, но вся братия Лопотова монастыря подала прошение о нежелании иметь Фаллассия настоятелем; тогда он был переведен в Устюжский Николаево-Прилуцкий монастырь. Этим кончается история Коряжемского монастыря до его упразднения. До какого положения дошел монастырь в то время, когда он был приписным, увидим из следующей главы.