Отдельной работой было сотрудничество РСХА и Абвера с различными группами террористов по всей Европе и Азии и вовлечение их в подрывную деятельность. В специально созданных для этих целей приказом Скорцени центрах в Зандберге и Фридентале готовились боевики из украинской ОУН, ирландской ИРА, турецкой группы пантюркистов «Серых волков» Тюргеши, индийцев группы Чаидра Бозе, хорватских «усташей» Павелича, румынской «Железной гвардии» Симы, македонцев ВМРО, арабов, прибалтов, словаков, валлийцев, китайцев, афганцев и др. Работе с этими группами Скорцени придавал особое значение. Руководить лагерем подготовки диверсантов во Фридентале он доверил своему заместителю Дитерихсу. С русскими диверсантами из власовской РОА работали такие специалисты Абвера, как Штрик-Штрикфельд, Хеммильг, Гелен (будующий глава разведки ФРГ после войны), а также диверсанты СД - Аусланд Грайф и Херре. Турок курировал сам фон Папен, затем посол Гитлера в Турции. Фламандских террористов — начальник СД в Бельгии Томас и Гиске из Абвера. Кавказцев из республик СССР — фон Паннвиц, после войны повешенный в Москве. Французов — Райндль, фон Реппель, Блайхор, Барбье. Китайцев — Лисснер из Абвера. Другими словами, задействованы в этой программе были лучшие кадры обеих спецслужб.
С ирландскими террористами ИРА работали сотрудники Абвера Гертц, Карл, Вебер, поддерживавший прямой контакт с руководителями ировцев Райаном и Хелдом в течение всей войны. Ирландцы помогали в высадках немецких агентов на побережье и в проведении терактов в королевстве. Позднее в ходе антибританской акции «Грюн» Абвер втянул в эту работу и валлийских сепаратистов.
С 1944 г. в спецслужбах наступил разлад, усугубляемый взаимной неприязнью начальника Абвера Канариса и руководства РСХА. Внутри Абвера возник начиная с 1942 г. заговор, направленный на устранение Гитлера и сепаратный мир с Америкой и Англией во имя сохранения независимости Германии. Во главе его были Канарис, сменивший его после опалы в начале 1944 г. Гансен, его заместитель Остер, начальник диверсионного отдела фон Лахонсен, а также многие офицеры вермахта и начальник отдела Крипо в РСХА Небе. Поддерживая связь с британцами и американской УСС через своего курьера Мюллера, единомышленников из разведки союзной Венгрии и верхушку Ватикана, эта группа организовала в 1944 г. неудачное покушение на Гитлера в его резиденции Вольфшанце. В результате после подавления выступления верными фюреру част ями армии и СС почти все руководство Абвера было арестовано. Канарис, Гансен, Остер, фон Догнан, начальник Крипо Небе были повешены. Немногие, как фон Лахонсен, дожили в лагерях до поражения Германии, причем некоторых из них прямо при освобождении арестовал советский СМЕРШ и вывез для допросов в Москву, Так, пропал в застенках НКВД известный воеиный разведчик, резидент Абвера еще в довоенном Советском Союзе Нидермайер, видный участник заговора Канариса. Абвер в 1944 г. за измену расформирован как отдельная спецслужба, многих его офицеров в 1945 г. это спасло от суда, например Гелена: Нюрнбергский трибунал не посчитал Абвер преступной организацией в отличие от РСХА. Остатки Абвера в 1944 г. придали в СД-Аусланд к Шелленбергу как отдел военной разведки «Курфюрст» во главе с Буртоком.
Сам Шелленберг в последние дни рейха предпринял попытку вместе с вождями СС Гиммлером и Вольфом заключить секретное соглашение с союзниками из США и Великобритании. Скорцени же до конца оставался верен фюреру, пытаясь в последние дни перед капитуляцией создать подпольные группы террористов «Шпинне» («Паук») и «Вервольф» («Оборотень») для партизанской войны. Скорцени и Ванк сменили Шелленберга в последние дни войны на посту главы СД-Аусланд. Тем не менее после ареста и суда в 1945 г. и Шелленберг, и Скорпени за предоставленную американской разведке ценную информацию получили право на жизнь. Выйдя из заключения, оба опубликовали свои мемуары.
История спецслужб ФРГ в 1949–1990 гг. органично вплетена в великое противостояние западных и восточных разведок, в этой войне западногерманские разведчики сталкивались с соотечественниками из ГДР.
