Индонезия к 1965 г. имела только одну спецслужбу — Министерство государственной безопасности (МГБ). Его основатель генерал Сутарто был соратником первого президента и в заговоре против него не участвовал. Напротив, Сутарто принимал все меры для подавления военного мятежа Симбалона и даже блокировался с коммунистами, планировавшими захват власти. Арестованный в 1965 г. мятежными офицерами Сутарто был осужден и провел в заключении почти 30 лет. Во главе МГБ новый диктатор страны Сухарто, безраздельно хозяйничавший в Индонезии до 1998 г., ставил преданных армейских генералов, таких как его дальний родственник Юдхаено.
С 1965 г. правившая страной семья Сухарто создала помимо МГБ еще две специальные службы: «Копкамтиб» (Командование операциями по безопасности и порядку) — классическая тайная полиция и Стратегический департамент — орган военной разведки и контрразведки, также занимавшийся внутренней госбезопасностью. «Копкамтиб», выполнившее свою функцию по подавлению оппозиции и запятнавшее себя большой кровью, в 1990 г. упразднено Сухарто. Стратегический департамент пережил крах режима Сухарто.
С 1965 г. при Сухарто действовали при армии «центры тревоги», сочетавшие функции бригад антитеррора и пыточных отделов. В армии существовали антитеррористическое подразделение № 81 и группа особого назначения «Копассус», созданная генералом Таньюгом, ставшим впоследствии министром обороны. В последние годы правления Сухарто «Копассус», ориентированная на антипартизанские действия в джунглях и подавление волнений в стране, возглавлял зять диктатора Правово.
Убийства, незаконные аресты и пытки МГБ, Стратегический департамент и «Копкамтиб» применяли как против левой оппозиции, так и против студенческого движения, прозападных интеллигентов, радикальных исламистов, христиан, национальных лидеров отдельных провинций. Уничтожены активисты национальных движений Тимора, Ачеха, Суматры, Молуккских островов, Борнео. Лидер тиморских партизан Лобано ликвидирован в 1975 г. сотрудниками «Копкамтиб», его преемник Гусмао захвачен в 1992 г. и после жесткого следствия осужден. Лидер мусульман Ачеха — султан Тибо бежал в европейскую эмиграцию, укрывшись в далекой Швеции. Митинги тиморцев в Дили беспощадно расстреливались. Карательные рейды спецназа «Копассус» по селам тиморцев, молуккцев, ачехцев, даяков с Борнео и папуасов мятежного острова Ириан-Джайя возглавлял будущий министр обороны генерал Таньюг. К этим операциям с конца 60-х годов привлекали европейских наемников. Индонезийский спецназ единственный в мире применял против уличных демонстрантов ядовитых змей. Митинги студентов против клана Сухарто разгонялись жестоко, трупы после акций оставались постоянно.
В 1996 г. начала набирать силу оппозиция. Массовые митинги, Демократической партии в Джакарте были разгромлены спецназом «Копассус» и бойцами «центров тревоги», стянутыми в столицу. Начальник Стратегического департамента генерал Суено, на который возложили обязанности расформированной охранки «Копкамтиб», за робкие предложения в Совете безопасности страны о диалоге с оппозицией был немедленно снят Сухарто с должности с формулировкой «за нерешительность и трусость». На его место назначен генерал Таруб, сделавший себе имя на подавлении сепаратистов окраин. Сухарто приказал Тарубу, начальнику МГБ Юдхаено и возглавлявшему спецгруппу «Копассус» своему зятю Прабово не жалеть патронов и задавить волнения.
Однако к демократам присоединились мятежные студенты, затем исламисты «Союза мусульман» Рияда, начавшие погромы китайских иммигрантов, и после массовых волнений в Джакарте, Мидане, на Суматре и Яве режий рухнул. Сухарто ушел в отставку в обмен на амнистию, его семья отстранена от экономических рычагов власти. С должности сняты почти все высшие офицеры сухартовских тайных служб, включая зятя диктатора Прабово и его племянника Хартумо. Служивший в тайных службах сын Сухарто Хутомо («Томми») был арестован и осужден.
Палестина была признана членом ООН, ее президента и председателя Организации освобождения Палестины (ООП) Ясира Арафата принимали в других странах как главу суверенного государства, он имел свое правительство, МИД, представителя в ООН и собственные палестинские спецслужбы. При этом вся страна была оккупирована Израилем, и до 1993 г. правительство Арафата пребывало в изгнании сначала в Ливане, а затем в Тунисе. Вооруженные силы и спецслужбы, как и вся ООП, вели партизанско-террористическую войну против Израиля. Что касается спецслужб Арафата — это скорее передовые отряды иди разведка повстанческой армии.
