19 декабря 1999 года состоялись выборы в Государственную Думу.
31 декабря 1999 года Б. Ельцин подписал Указ Президента Российской Федерации «Об исполнении полномочий Президента Российской Федерации».
В соответствии с частью 2 статьи 92 Конституции Российской Федерации прекращаю с 12 часов 00 минут 31 декабря 1999 г. исполнение полномочий Президента Российской Федерации. В соответствии с частью 3 статьи 92 Конституции Российской Федерации полномочия Президента Российской Федерации временно исполняет Председатель Правительства Российской Федерации с 12 часов 00 минут 31 декабря 1999 г. Настоящий Указ вступает в силу с момента его подписания.
В. Путин подписал Указ Президента Российской Федерации «О временном исполнении полномочий Президента Российской Федерации». В связи с отставкой Президента Российской Федерации Б.Ельцина приступил в соответствии со статьёй 92 Конституции Российской Федерации к временному исполнению полномочий Президента Российской Федерации с 12 часов 00 минут 31 декабря 1999 г. Б. Ельцин освободил своим Указом, а и.о. Президента РФ В. Путин вновь назначил Александра Стальевича Волошина Руководителем Администрации Президента РФ. И.о. Президента РФ В. Путин подписал Указ «О гарантиях Президенту Российской Федерации, прекратившему исполнение своих полномочий, и членам его семьи».
10 января 2000 года и.о. Президента РФ Владимир Путин своим указом назначил Михаила Касьянова первым заместителем председателя Правительства РФ — министром финансов РФ.
2 февраля 2000 года на пресс-конференции Юрий Скуратов ответил на предъявление ему официального обвинения по «делу о пиджаках» словесными обвинениями в адрес Кремля. «Все кремлёвское окружение причастно к коррупции. Есть материалы на Волошина, Абрамовича, Мамута». Степень «причастности» этих лиц он не указал. Активное противоборство с Кремлём он ограничил пока заявлением в суд с просьбой освободить его от подписки о невыезде.
4 февраля 2000 года Хамовнический суд Москвы вновь рассматривал жалобу отстранённого генпрокурора Юрия Скуратова на незаконное продление срока следствия по его делу. За время судебных разбирательств Генеральная прокуратура уже дважды продлевала срок следствия, а 31.01 предъявила Ю.Скуратову официальное обвинение в злоупотреблении должностными полномочиями.
11 февраля 2000 года адвокаты Юрия Скуратова направили в Мосгорсуд жалобу на решение Хамовнического суда Москвы, который 7 февраля признал законным продление срока следствия по уголовному делу Ю.Скуратова. В интервью адвокат Андрей Похмелкин отметил, что в ходе судебного заседания не был рассмотрен ни один довод защиты. Суд оставил без внимания тот факт, что продление Главной военной прокуратурой срока следствия до 6 месяцев, учитывая, что статус Ю.Скуратова по делу, на тот момент не был определён, «нарушает его конституционные права».
21 февраля 2000 года Скуратов зарегистрирован ЦИК в качестве кандидата на пост Президента РФ.
15 марта 2000 года мэр Москвы Юрий Лужков заявил, что «Отечество» готово поддержать Владимира Путина на президентских выборах при определённых гарантиях. Среди таких условий Ю. Лужков назвал «сохранение демократических свобод, отказ от диктатуры со стороны олигархов в политике и экономике, поддержку реального сектора, укрепление государственной власти».
26 марта 2000 года Владимир Путин избран президентом РФ.
17 мая 2000 года Совет Федерации утвердил на посту Генерального Прокурора России Владимира Устинова. За него проголосовали 114, против 10, воздержались 9 членов палаты.