16 сентября 1999 года в Волгодонске взорван жилой дом. Имелись жертвы.
17 сентября 1999 года в Санкт-Петербурге в жилом доме сработало взрывное устройство. Мощность взрыва приравнивается к 4 кг тротила. В результате взрыва погибли 4 человека.
30 сентября 1999 года в Санкт-Петербурге открылось 6-е заседание Совета руководителей органов безопасности и специальных служб (СОРБ) СНГ. Членами этой организации являются 10 государств, Туркмения и Узбекистан участвуют в работе СОРБа в качестве наблюдателей.
5 октября 1999 года в Кремле состоялось совещание членов Совета безопасности РФ, на котором была принята новая «Концепция национальной безопасности» России. Этот документ должен сменить предыдущий с аналогичным названием, который был введён в действие указом президента Ельцина 17 декабря 1997 г.
8 октября 1999 года опубликован проект Договора о создании Союзного государства и Программа действий Российской Федерации и Республики Беларусь по реализации положений Договора о создании Союзного государства.
13 октября 1999 года Совет Федерации в третий раз отклонил требование главы государства отправить в отставку Ю. Скуратова с поста Генерального прокурора РФ. За отставку проголосовало 52 сенатора, против неё — 98. Б. Ельцин на это заявил: «Этот высокий пост не может занимать человек, дискредитировавший высокое звание прокурора».
14 октября 1999 года реагируя на сообщения СМИ о коррупции в верхних эшелонах власти России, пресс-служба Президента РФ сообщила, что «Б. Ельцин не имеет за рубежом ни счётов, ни имущества». По поводу публикаций в СМИ и высказываний Ю. Скуратова пресс-служба президента РФ «неоднократно заявляла, что никаких зарубежных счётов президент России не открывали зарубежной собственности у него не было и нет. Сведения о доходах и имуществе главы государства и членов его семьи, поданные в соответствии с указом самого президента России, надлежащим образом задекларированы и опубликованы в отечественных печатных изданиях».
15 октября 1999 года Мосгорсуд оставил в силе решение суда первой инстанции (Хамовнического) о незаконности продления расследования по делу, возбуждённому против опального генпрокурора. Генпрокуратура заявила о намерении опротестовать это решение в Верховном суде. По этому поводу пресс-секретарь Б. Ельцина Дмитрий Якушкин заявил, что президет по-прежнему убеждён в невозможности возвращения Юрия Скуратова на пост генерального прокурора, т.к. он «считает Скуратова нечистоплотным человеком, нарушившим прокурорскую этику».
16 октября 1999 года оперативным подразделениям МВД и ФСБ РФ стало известно, что чеченские боевики вновь вынашивают планы проведения террористических актов на территории России. Об этом говорится в сообщении Управления информации МВД и Центра общественных связей ФСБ России. В сообщении подчёркивается, что со стороны правоохранительных органов РФ «предпринимаются все необходимые меры для предотвращения подобных действий со стороны бандитов».
18 октября 1999 года отстранённый от работы генеральный прокурор РФ Юрий Скуратов направил председателю Совета Федерации Егору Строеву письмо, в котором просит спикера палаты о содействии его возвращению к исполнению обязанностей генпрокурора. В соответствии с регламентом Совет верхней палаты может рекомендовать Совету Федерации рассмотреть данный вопрос на заседании.
24 октября 1999 года опубликовано заявление Правительства Российской Федерации о ситуации в Чеченской Республике и мерах по её урегулированию.
28 октября 1999 года лидеры блока «Отечество — Вся Россия» Е. Примаков, Ю.Лужков и В.Яковлев обратились к президенту РФ Б.Ельцину с открытым письмом. В нем говорится, что президент России изолировал себя от управления страной и перепоручил это своему ближайшему окружению, которое вмешивается незаконно в предвыборные процессы, и нарушает законы и Конституцию. Лидеры блока призвали Б. Ельцина отправить в отставку скомпрометировавших себя чиновников из его администрации и лично встретиться с руководителями политических партий и движений.
3 ноября 1999 года премьер-министр Владимир Путин заявил о необходимости в России новой общенациональной идеологии, в основу которой должен быть положен патриотизм. Встречаясь в Доме правительства с ректорами крупнейших российских вузов, премьер отметил, что «после масштабных преобразований в стране образовался идеологический вакуум, одна идеология была утрачена, и ничего не было предложено взамен». В основе новой идеологии должен лежать «патриотизм в самом положительном смысле этого понятия», считает Путин.
