1917
Работал в Земском городском союзе (Земгор), Высшем Совете народного хозяйства (ВСНХ).
1917–1919
Занимался реставрацией, возглавлял комиссии по восстановлению Московского Кремля, памятников Ярославля, охране памятников Троице-Сергиевой лавры.
Работал в советских учреждениях культуры: заведовал подотделом архитектуры, живописи и реставрации музейного отдела Наркомпроса, был членом коллегии по делам музеев и охране памятников искусства и старины Наркомпроса.
1919–1920
Участвовал в организации Уфимского политехникума.
Принял активное участие в 2-х научных экспедициях Наркомпроса по обследованию памятников архитектуры и искусства Поволжья (Верхней и Средней Волги) и Владимира.
1920
Организовал художественный музей на основе коллекции картин М. В. Нестерова (с 1926 г. — Государственный музей искусств им. М. В. Нестерова) и библиотеку при нем (Уфа).
1919–1921
Работал директором Управления художественных музеев в Уфе.
1921
Участвовал в реорганизации Самарского художественного музея.
Участвовал в строительстве павильонов Сельскохозяйственной выставки в Москве.
1 февраля — родился сын Николай.
1922
9 февраля умерла первая жена — Елизавета Александровна Бондаренко.
1922
Организовал выставку «Красная Москва», на базе которой позднее был основан Музей Революции.
1923
Построил павильон Деткомиссии ВЦИК на Всероссийской сельскохозяйственной и кустарно-промышленной выставке (Москва, близ Нескучного сада; не сохранился).
17 сентября — женился на Татьяне Ивановне (урожд.?), матери сына Николая.
1923–1924
Построил центральное здание Московского союза крестьянских молочных товариществ (Москва, ул Достоевского (2-й Мариинский пер.), 10, не сохранилось).
1924–1926
Работал экспертом Высшей арбитражной комиссии при Совете труда и обороны (СТО) по обследованию жилищного фонда и лечебных мест в Крыму.
Работал в правительственной Комиссии по восстановлению Ленинграда после наводнения 1924 г.
1926–1927
Работал архитектором Государственного исторического музея в Москве.
1928–1930 Был членом Московского управления недвижимым имуществом (МУНИ) отдела благоустройства Моссовета, руководил Строительно-техническим бюро РТО.
1929
Осуществил постройку поселка «Эмбанефть» (Гурьев).
1930
Возвел здание Дальневосточного института рыбного хозяйства (Владивосток).
1932
Выполнил проект здания института Гражданстроя (не осуществлен).
1932–1933 Надстроил здание и пристроил дополнительные помещения к Московской консерватории (Москва, Б. Никитская, 13).
1933–1934 Возвел пристройку к зданию Государственной Третьяковской галереи
(Москва, Лаврушинский пер., 6).
1933, 1940 Надстроил здание Мосэнерго (Москва, Раушская наб.).
1934–1937 Стал экспертом отделения проектирования и планирования Моссовета.
1935–1939 Работал главным архитектором строительного отдела Мосэнерго.
1936–1937 Построил дачу для артиста Большого театра А. И. Алексеева (Московская обл.).
1937
Создал проекты выставочных павильонов.
1937–1938
Сделал проект надстройки здания Театрального музея имени А. А. Бахрушина (Москва, Зацепский вал, 12; не осуществлен).
1938
Сделал проект пристройки к Государственному музею изобразительных искусств имени А. С. Пушкина (Москва, Волхонка,12; не осуществлен).
Переиздал книгу «Архитектор Матвей Федорович Казаков. 1738–1813*» (М., 1938).
Приступил к работе над большой монографией о М. Ф. Казакове (не завершена).
1938–1941
Работал над воспоминаниями «Записки художника-архитектора» (подготовил рукопись к печати).
1942–1946
Читал лекции по истории архитектуры Москвы на курсах повышения квалификации архитекторов при Союзе советских архитекторов, на радио и в госпиталях для раненых бойцов.
1943–1944
Работал главным архитектором Ваганьковского и Армянского кладбищ; создал ряд проектов мемориальных построек и памятников на их территориях (Москва).
1945–1946
Участвовал в послевоенном восстановлении здания Путевого дворца в Твери.
1940-е
Работал над «Словарем русских зодчих и иностранцев, работавших в России» (не завершен).
27 июля 1947
Скончался в Москве; прах И. Е. Бондаренко был захоронен в колумбарии Нового Донского кладбища, в настоящее время захоронение утрачено.