1939, декабрь — Награжден орденом Ленина за успешную работу по руководству оперативной деятельностью Красной Армии.
1940, май — Присвоено звание Маршала Советского Союза.
1940, август — Заместитель Народного комиссара обороны СССР.
1941, июнь — Постоянный Советник при Ставке Главного Командования Вооруженных Сил СССР.
1941, июль — Вновь назначен начальником Генерального штаба Красной Армии и введен в состав Ставки Верховного Командования (с августа — Главного командования) Вооруженных Сил СССР.
1942, май — Заместитель Народного комиссара обороны СССР
1942, октябрь — Награжден вторым орденом Ленина в связи с 60-летием со дня рождения. Присвоено имя Маршала Советского Союза Б.М. Шапошникова Высшим стрелково-тактическим Краснознаменным курсам усовершенствования комсостава пехоты Красной Армии и Первому пехотному Тамбовскому Краснознаменному училищу.
1943, июнь — Начальник Высшей военной академии имени К.Е. Ворошилова.
1943, сентябрь — Решением Политбюро ЦК партии утвержден членом Комиссии по вопросам перемирия (впоследствии Комиссии по перемирию с Германией и Комиссии по перемирию с Финляндией, Венгрией и Румынией).
1944, февраль — Награжден орденом Суворова I степени.
1944, ноябрь — Награжден вторым орденом Красного Знамени.
1945, февраль — Награжден третьим орденом Ленина и медалью «За оборону Москвы».
1945, 26 марта — Смерть Б.М. Шапошникова от туберкулеза.
1945, 28 марта — Похороны Маршала Советского Союза Б.М. Шапошникова на Красной площади в Москве.
ПЕЧАТНЫЕ РАБОТЫ Б. М. ШАПОШНИКОВА
I. Книги
1. Конница (кавалерийские очерки). Москва, 1923 г., тираж 2000 экз.
2. На Висле. К истории кампании 1920 года. Москва, 1924 г., тираж 3000 экз.
3. Мозг армии, книга I. Москва, 1927 г., тираж 5000 экз.
4. Мозг армии, книга II. Москва, 1929 г., тираж 4000 экз.
5. Мозг армии, книга III. Москва, 1929 г., тираж 4000 экз.
6. Варшавская операция (конспект). Москва, 1933 г., тираж 600 экз.
7. Пройденный путь, 1882–1915 гг. (Рукопись частично публиковалась в «Военно-историческом журнале» № 6–9, 12 за 1966 г., 1, 3 и 6 за 1967 г.).
II. Статьи
8. Месяц в тылу противника. Журнал «Военное дело». Москва, 1918 г., № 27.
9. Очерки из действий русской конницы в мировую войну. Сборник статей по военному искусству, кн. I. Москва, 1919 г.
10. Мираж и действительность. «Военное дело», 1919 г., № 2.
11. Рейды конницы. «Военное дело», 1919 г., № 28–29.
12. Конные массы. «Военное дело», 1919 г., № 34–35.
13. Обзор военных действий Красной Армии (с 7 ноября по 1 декабря). «Военное дело», 1919 г., № 34–35.
14. Обзор боевых действий Красной Армии за декабрь 1919 г. «Военное дело», 1920 г., № 1.
15. Обзор боевых действий Красной Армии в январе 1920 г. «Военное дело», 1920 г., № 2.
16. Обзор боевых действий Красной Армии в феврале 1920 г. «Военное дело», 1920 г., № 4.
17. Обзор боевых действий Красной Армии в марте 1920 г. «Военное дело», 1920 г., № 9.
18. Милиционная конница. «Военное дело», 1920 г., № 10.
19. Обзор боевых действий Красной Армии в апреле 1920 г. «Военное дело», 1920 г., № 11.
20. Милиционная конница. «Военное дело», 1920 г., № 12.
21. Первые боевые шаги маршала Пилсудского. «Военное дело», 1920 г., № 13.
22. Обзор боевых действий Красной Армии в мае 1920 г. «Военное дело», 1920 г., № 13.
23. Польская армия. «Военное дело», 1920 г., № 15.
24. Современное значение конницы и ее задачи. Сборник статей по военному искусству, вып. 2. Москва, 1920 г.
25. Конные массы на фланге армии. Журнал «Военная наука и революция», Москва, 1921 г., № 1–2.
26. Рецензия на книгу «Доблестная зашита Петрограда в октябре 1919 года». Журнал «Печать и революция», кн. I.
27. Армейская конница в маневренной войне. Сборник статей по военному искусству. Москва, 1921 г.
28. Конница в гражданской войне. «Революция и война», 1921, сборник № 6–7.
29. Красная конница. Журнал «Политработник», 1923 г., № 1–2.
30. Мечты Мюрата наших дней. Журнал «Военный вестник», Москва, 1923 г., № 9—10.
31. Свержение богов. «Военный вестник», 1923 г., № 7.
32. Первый выпуск особой группы. «Красная звезда», 1932 г., № 197.
33. Он давал пример подлинно кипучей деятельности (памяти П.П. Лебедева). «Красная звезда», 4 июля 1933 г.