В данной ситуации Елисейский дворец оказался перед трудным выбором — полностью самоустраниться или продолжать оставаться «жандармом Африки». В обоих случаях он становился объектом жесточайшей критики. Но спасительное решение было найдено — миротворческая миссия африканских стран MISAB (Mission Interafricaine de Surveilliance des Accords de Bangui). 800 солдат из Буркина-Фасо, Чада, Габона, Мали и Того размещались между мятежниками и правительственными войсками. Финансовое обеспечение миссии (600 тысяч долларов в месяц) взяла на себя Франция. 25 января 1997 года было подписано в Банги соответствующее соглашение при посредничестве группы глав государств Западной Африки. При этом французская группировка (1,3 тысячи бойцов) осталась в стране. Формирование президентских частей взял на себя капитан Поль Барриль — заместитель командира элитного антитеррористического подразделения Елисейского дворца. В апреле 1998 года MISAB сменила MINURCA (Mission de Nations Unies en RCA) — контингенты 14 африканских стран и Франции (почти 1,6 тысячи военных и полицейских). Но 28 февраля 1999 года последний французский солдат покинул ЦАР.
На выборах в сентябре 1999 года победил Анж-Феликс Патассе. В ночь с 27 на 28 мая 2000 года его дворец атаковали хорошо вооруженные коммандос генерала Колингбы, но после отчаянной перестрелки они отступили. В ноябре 2001 года сторонники начальника Генштаба вооруженных сил ЦАР генерала Франсуа Бозизе и правительственные части при поддержке ливийцев и заирцев развернули пятидневное сражение на улицах Банги. Обращение Патассе за помощью к ливийскому лидеру Муаммару Каддафи определило его судьбу. Франция поддержала Бозизе, который с помощью президентов Габона, ДРК, Чада и Конго сформировал свою президентскую гвардию «Группировка 4». В марте 2003 года колонны повстанцев, в которых основную ударную силу составляли чадцы, двинулись на Банги. Миротворцы не препятствовали их движению. 15 марта повстанцев вошли в столицу. Патассе был в этот момент в Нигере на саммите стран Центральной Африки. Франция осталась безучастной к его просьбам о военной интервенции. В ЦАР были посланы лишь 300 солдат в рамках операции Boali для защиты французских граждан. В ходе развернувшейся затем гражданской войны (2004-2007) между сторонниками Бозизе и Патассе французские войска сохраняли нейтралитет, ограничиваясь подготовкой частей регулярной армии ЦАР и поставками вооружений и автотехники.
Франция вмешалась в конфликт вновь, когда 30 октября 2006 года боевики движения UFDR (Union des Forces Democratiques pour le Rassemblement) атаковали стратегически важный город Бирао (префектура Вакага) на севере страны, где захватили много оружия и боеприпасов. Вскоре повстанцы заняли три северные префектуры. Ситуация становилась критической. 27 ноября вооруженные силы ЦАР при тактической и логистической поддержке Франции начали контрнаступление. В операции было задействовано 300 французских солдат и офицеров.
В Бирао было развернуто французское подразделение оперативной поддержки (ПОП) — 18 человек, включая доктора и двух медсестер. 3 марта повстанцы начали новое наступление на Бирао. Свидетели боев отмечали их скоординированные действия, высокую мотивацию, неплохую подготовку, их хорошее вооружение и экипировку, включавшую спутниковые телефоны.
Два французских Mirage F-1CR, вызванные для поддержки из Нджамены, нанесли удар по повстанческим колоннам, уничтожив 30-мм пушку, четыре «технички» и грузовик. Но город оставался в осаде, а с ним и французские врачи из ПОП.
Для спасения своих граждан Франция провела самую масштабную десантную операцию со времен Кольвези. В ночь с 4 на 5 марта десять бойцов 3-го парашютного полка спрыгнули затяжным прыжком с транспортника С160 в Бирао и установили контакт с ПОП, второй самолет ночью 6 марта высадил еще 58 парашютистов. После того как была занята ВПП в 10 км от города, там приземлился С160 с ротой 3-го полка (130 человек). Бирао был отбит, прилегающие территории зачищены. С французской стороны потерь не было, армия ЦАР потеряла 6 убитыми и 18 раненными. Потери повстанцев — по крайней мере, 30 убитых.