В итоге ливийцы через три недели отбили Аузу, использовав тактику противника. Их джипы и бронемашины на скорости прорвали вражеские позиции вокруг оазиса и разгромили чадские части. Но чадцы нанесли совершенно неожиданный удар уже в глубь ливийской территории по авиабазе Маатан-эс-Сарра в ста километрах от границы в начале сентября 1987 г. На этот раз ливийцы были настолько не готовы к отражению атаки, что даже ни один самолет не взлетел с взлетной полосы, было уничтожено 22 самолета и вертолета, включая вертолеты Ми- 25, три истребителя МиГ-23 и четыре Mirage.
В ответ Ливия решилась испытать на прочность французскую ПВО. Дальний бомбардировщику Ту-22 попытался атаковать Нджамену. Один был сбит ракетой ЗРК MIM-23 Hawk батареи 403-го полка еще до того, как сбросил бомбы. Одновременно другой Ту-22 нанес бомбовый удар по Абеше, но результаты его были ничтожны.
Стратегически от рейда на Маатан-эс-Сарра президент Хабре выиграл мало. Франция, боясь, что освободительный поход может превратиться теперь уже чадскую интервенцию против Ливии, стала оказывать давление на своего союзника, требуя, чтобы он заключил перемирие и решил проблему Аузу путем переговоров.
11 сентября 1987 г. Хабре и Каддафи подписали соглашение о прекращении огня при посредничестве ОАЕ. «Война на «тойотах» закончилась. Полоса Аузу осталась ливийской.
Французы занялись гуманитарными операциями, в том числе разминированием северного Чада, что взяла на себя рота 17-го инженерного полка. 4 января 1988 года французы потеряли первого бойца в ходе операции Epervier. Ливия потеряла в войне на «тойотах» 7,5 тысячи человек убитыми и тысячу пленными, а также военной техники и имущества на полтора миллиарда долларов. Потери чадцев — более тысячи человек.
После того как в октябре 1988 года Триполи и Нджамена восстановили дипломатические отношения, Франция начала сокращать свое присутствие. В 1989 году осталось тысяча военнослужащих Франции, большинство баз было ликвидировано.
В апреле 1989 года официальный победитель в войне на «тойотах» главнокомандующий ЧНВС Хассан Джамусс и министр обороны Идрис Дэби попытались свергнуть Хабре. Но заговор не удался. Джамусса казнили, Дэби бежал в Судан. Через год он вернулся с новой повстанческой армией. Франция к этому времени потеряла интерес к Хабре из-за его заигрываний с США и постоянных нарушений прав человека. К тому же «холодная война» закончилась, а с ней и борьба за континент между Западом и Востоком. Хабре пришлось просить политического убежища в Камеруне. Интересно, что во время марша Дэби на Нджамену его сопровождал офицер DGSE Поль Фонбонн. Когда повстанцы занимали столицу, французы оставались нейтральными, охраняли аэропорт, посольство и электростанцию и обеспечивали эвакуацию 1250 европейцев.
Новый президент Чада Идрис Дэби сохранил с Францией партнерские отношения, но в то же время объявил о своей проливийской ориентации. Париж закрыл на это глаза. Более того, чтобы не раздражать Каддафи, французская разведка при помощи ЦРУ тайно вывезла в Нигерию отряды Хафтар — ливийских дезертиров на службе армии Чада. Французская авиация в 1992 году активно помогала правительственным частям в подавлении двух военных мятежей, инспирированных Хиссеном Хабре.
В 1994 году Международный арбитражный суд вынес решение по поводу полосы Аузу в пользу Чада. Ливия признала это решение и вывела свои войска.
Очередное усиление французской группировки в Чаде произошло только через двадцать лет. В 2005 году гражданская война вспыхнула с новой силой. Повстанцев поддержало правительство Судана, Идрис Дэби, в свою очередь, оказывал значительную помощь антиправительственным группировкам суданского Дарфура. Таким образом, гражданская война в Чаде стала одновременно и «опосредованным» чадско-суданским вооруженным конфликтом. 13 апреля 2006 года повстанческие отряды Объединенного фронта за перемены в предрассветные часы атаковали Нджамену. Им удалось захватить здание Национальной ассамблеи, но закрепить успех они не смогли. Армейские части выбили повстанцев из столицы, 370 боевиков были убиты, более 270 взяты в плен. В этот раз вмешательство французской армии не потребовалось. Однако в апреле 2006 года Париж увеличил свою группировку в Чаде до 1,5 тысячи военнослужащих. С декабря 2007 года часть этих войск была включена в европейскую миротворческую миссию в Чаде и ЦАР под мандатом ООН EUFOR Tchad/RCA (мандат миссии истек 31 декабря 2010 года).
