В 1999 г. И.М. Ильинский вместе с выдающимся математиком, академиком РАН Н.Н. Моисеевым и всемирно известным философом и социологом А.А. Зиновьевым создал в университете Русский интеллектуальный клуб, члены которого с участием экспертов обсуждают наиболее актуальные проблемы современного мира и России. С 2006 г. И.М. Ильинский — президент этого клуба.
Инициатор создания и главный редактор журнала «Знание. Понимание. Умение» — одного из ведущих журналов России в области гуманитарных наук. Организатор крупнейших международных научных конференций «Высшее образование для XXI века» (в 2004–2014 гг. прошли 11 конференций, общее число участников которых превысило 5000 человек).
И.М. Ильинский — публицист, прозаик, поэт, член Союза писателей России. С 2005 г. И.М. Ильинский — один из учредителей и председатель Попечительского совета литературной Бунинской премии.
И.М. Ильинский отмечен высокими государственными наградами: орденами «За заслуги перед Отечеством» IV степени (2006), Почёта (2001), Дружбы (1996), Благодарностью Президента РФ В.В. Путина (2014), медалями СССР и России, а также Почётными грамотами Совета Федерации РФ, Государственной Думы РФ, Правительства Москвы, высшей наградой Правительства Москвы — знаком отличия «За заслуги перед Москвой», знаками Министерства образования РФ, К.Д. Ушинского «За заслуги в области педагогической науки» (1996), «Почётный работник высшего профессионального образования» (1999), «Почётный работник сферы молодёжной политики» (2002). Среди общественных наград — премия Ленинского комсомола в области науки (1991), высшая общественная награда России — Золотой почётный знак «Общественное признание», орден Ломоносова Национального комитета общественных наград (2006). Доверенное лицо Президента РФ В.В. Путина.