Примерно в 2.20 в штабе округа был принят приказ наркома обороны СССР, в котором войска предупреждались о возможности провокаций со стороны Румынии на которые они не должны были поддаваться. Этим приказом введение в действия Плана прикрытия государственной границы, выработанного ранее, практически запрещалось. Но механизм уже был запущен, и остановить его было очень трудно.
О том, как начиналась война в полосе войск 9-й армии, ее командующий Я.Т. Черевиченко воспоминаний также не оставил.
Из архивных материалов следует, что в 4 часа 22 июня румынские и немецкие части открыли артиллерийский и пулеметный огонь по пограничным пунктам на советской территории. Одновременно румынская и германская авиация произвела налеты на города Бельцы, Кишинев, Дубоссары, Аккерман, Болград, Севастополь.
Г.П. Сечкин в книге «Граница и война» пишет, что границу с Румынией, проходившую по Пруту и Дунаю, охраняли погранвойска Молдавского округа (начальник войск генерал-майор Н.П. Никольский, заместитель по политической части бригадный комиссар А.В. Клюев).
Непосредственно по линии границы по Пруту стояли 23-й Липканский, 24-й Бельцкий, 2-й Каларашский и 25-й Кагульский пограничные отряды, на Дунае нес службу 79-й Измаильский пограничный отряд. На границе по Днестру стояло пять отдельных пограничных комендатур. Кроме того, морское побережье охраняли подразделения 26-го Одесского пограничного отряда.
На рассвете 22 июня 1941 года передовые отряды противника на плавсредствах скрытно стали переправляться на советскую территорию. Когда пограничники открыли огонь по этим отрядам, грохнула вражеская артиллерия. От артобстрела многие заставы превратились в груды развалин, была нарушена телефонная связь с отрядами. Но все попытки врага вклиниться на советскую территорию в течение 22 июня были успешно пресечены пограничниками и подоспевшими соединениями 35-го стрелкового корпуса. Остальные соединения выдвигались в свои полосы, ведя передовыми частями боевые действия с противником.
В ночь с 22 на 23 июня противнику удалось переправиться через реку Прут в районе города Кагула, а затем – еще на одном направлении. В 17 часов того же дня в полосе обороны соединений 2-го кавалерийского корпуса противнику удалось после артиллерийской подготовки прорваться на восточный берег реки Прут по железнодорожному мосту, который советские части не успели разрушить. Но налетом штурмовиков и контратакой двух эскадронов противник был отброшен к реке и был вынужден уйти на ее противоположный берег.
Высшее командование РККА понимало, что силами одной армии едва ли удастся отразить удар крупных сил противника на южном участке советско-германского фронта. Поэтому уже в 19 часов 22 июня из Москвы в Винницу специальным поездом убыла оперативная группа офицеров во главе с генералом армии И.В. Тюленевым, армейским комиссаром 1-го ранга А.И. Запорожцем и генерал-майором Г.Д. Шеиным. Для объединения действий советских войск против войск противника, действующих с территории Румынии, директивой народного комиссара обороны от 24 июня 1941 года был создан Южный фронт в составе 9-й армии (штаб – Каменец-Подольский), 18-й армий (штаб – Тирасполь) и 9-го отдельного стрелкового корпуса (штаб – Симферополь). Командующим фронтом был назначен генерал армии И.В. Тюленев, членом Военного совета – армейский комиссар 1-го ранга А.И. Запорожец, начальником штаба – генерал-майор Г.Д. Шишенин.
В течение 24 июня противник на всем фронте продолжал попытки форсировать реки Прут и Дунай, но все эти попытки, за исключением одного направления, были отражены советскими войсками. Только в районе Скулени врагу утром этого дня удалось силами до двух-трех пехотных полков с двадцатью танками и большим отрядом мотоциклистов форсировать реку Прут и закрепиться на ее восточном берегу.
В «Военно-историческом журнале» удалось найти статью крупных военных историков – преподавателей кафедры истории военного искусства Военной академии имени М.В. Фрунзе В.Н. Киселева и Н.М. Романичева, посвященную действиям войск Южного фронта в начале Великой Отечественной войны. Они, в частности, пишут, что 22 июня на южном участке советско-германского фронта противник «ударно-поисковыми» группами, состоящими из румынских соединений, попытался захватить мосты, плацдармы и создать видимость общего наступления. Используя промежутки в обороне советских войск, вражеские подразделения сумели захватить небольшие плацдармы в нескольких местах. Однако к исходу дня советским войскам удалось ликвидировать эти плацдармы. Только в районе Скулян отбросить врага за Прут не удалось. Для его ликвидации командующий предпринял контратаку силами 30-й горнострелковой дивизии, но успеха не добился.