В настоящее время Свято-Пантелеимоновский монастырь входит в число 20 монастырей Святой Афонской Горы и является одним из самых крупных и известных из них. Всего в обители имеется 25 храмов и параклисова. Вне ее стен в разных местах монастырской земли, скитах, метохах и при отшельнических келлиях находятся еще 36 церквей. Ежегодно обитель посещают несколько тысяч паломников: русских, украинцев, молдаван, белорусов, греков, болгар, сербов и др.
Свято-Пантелеимоновский монастырь известен во всем православном мире своими великими святынями. В главном соборе обители, посвященном в честь св. вмч. Пантелеймона, хранится честная глава этого великого святого, составляющая утешение и бесценное украшение и сокровище как храма и русской обители, так и всей Святой Горы Афонской. Многочисленные паломники из разных стран многократно получали и получают в монастыре исцеления и чудотворения от честной главы св. вмч. Пантелеймона целителя. Русскими паломниками особенно почитаема и помещенная в специальном саркофаге чудотворная десница св. Иоанна Русского. В Свято-Пантелеимоновском монастыре пребывает и великая христианская святыня — частица Ризы Пресвятой Богородицы.
В обители также хранятся: честная глава апостола и евангелиста Луки, глава преп. Силуана Афонского, стопа святого апостола Андрея Первозванного, частицы мощей Пророка, Предтечи и Крестителя Иоанна, апостолов Алфея, Тимофея, Иакова, Петра, Филиппа, Фомы, Варфоломея и Варнавы, первомч. архидиакона Стефана, свтт. Василия Великого, Григория Богослова и Иоанна Златоуста, свт. Кирилла Иерусалимского, сщмч. Дионисия Ареопагита, препмч. Стефана Нового, вмц. Марины, мчч. Трифона и Параскевы, свв. бессрр. Космы и Дамиана, преп. Исаакия Далматского, прав. Иосифа Обручника и других святых. Мощи заключены в серебряные оклады и выставлены под стеклом для поклонения.
В храме Покрова Богородицы находятся чудотворные списки с икон Божией Матери Казанской и Иерусалимской. В обители пребывает много и других чтимых икон, в частности древняя икона св. вмч. Пантелеймона, образ св. Иоанна Предтечи, икона Божией Матери «Игумения Святой Горы Афонской», икона свмч. Харалампия из скита св. Анны и мозаичная икона св. кн. Александра Невского.
Нынешнее значительное расширение и укрепление связей Русской Православной Церкви, верующего населения России, Украины, Белоруссии и Молдовы с Афоном дает надежду на дальнейшее возрождение русских обителей Святой Горы.
