Процесс введения новой экономической политики растянулся на весну-лето 1921 г. Весной 1921 г. на Украине партизанило около 160 отрядов самой разной направленности от петлюровцев до анархистов общей численностью около 40 тысяч бойцов. За исключением армии Махно они насчитывали от нескольких десятков до тысячи человек. Махновцев было несколько тысяч, но весной 1921 г. они были распылены.
22 мая 1921 г. Махно двинулся в новый рейд на север. Он смог сосредоточить для действий на Полтавщине лишь 1300 бойцов. В конце июня — начале июля М. Фрунзе нанес махновской ударной группе чувствительное поражение в районе рек Сула и Псел. Махно с небольшим отрядом прорвался через всю Украину к румынской границе и 28 августа 1921 г. переправился через Днестр в Бессарабию.
После отмены продразверстки в Тамбовской области начался закат Антоновского восстания. В феврале погиб сподвижник Антонова Токмаков. 22 марта 1921 г. повстанцы потерпели тяжелое поражение. В течение следующих трех недель явку с повинной принесло около 7 тыс. повстанцев. Однако в апреле — июле повстанцы продолжали проводить крупные рейды, нападать на города и станции. Особый отдел армии Тамбовской губернии докладывал о постановке разведки в июне — июле 1921 г.: «Агентам давались задания проникнуть в банду, убить или отравить активных главарей, дать сведения о ее состоянии, действиях, предполагаемых намерениях», но удались только 1–2 теракта. В условиях мобильной войны «массовый ввод в банды сотрудников никак не удавался, они никак не могли настигнуть банду и прилипнуть к ней». При этом часть агентов была убита красными.
Работа коммунистов по сдаче повстанцев в плен также часто срывалась. «В процессе работы большим тормозом послужили нетактичные действия ревкомов и войсковых частей, которые продолжали арестовывать и избивать агентов-парламентеров и добровольно сдавшихся бандитов, разгоняли банды, ведущие переговоры о сдаче, и тем срывали операции, подрывая доверие у желающих сдаться бандитов».
12 мая Тухачевский издал приказ № 130, а комиссия ВЦИК — постановление «О высылке семей и конфискации имущества бандитов», согласно которым семьи повстанцев брались в заложники и направлялись в концлагеря до конца восстания, а часть — высылалась на Север, имущество конфисковывалось. 11 июня был принят приказ № 171, в соответствии с которым в случае обнаружения оружия расстреливались заложники.
25 мая — 7 июня сводная кавалерийская группа под командованием И. Уборевича нанесла решительное поражение основным силам Антонова. Но только в июле оставшиеся отряды были практически полностью разгромлены. На завершающем этапе операции против повстанцев было применено химическое оружие, правда, из-за нарушения инструкции — без большого успеха. 22–26 июня был обнаружен и разгромлен губернский СТК. В июле репрессивная политика стала смягчаться. 3 июля 1921 г. комиссия по борьбе с бандитизмом под председательством Э. Склянского приняла постановление по Тамбовской губернии, в котором говорилось: «Применять выселение семей в ограниченных размерах по отношению к семьям злостных активных бандитов, преследуя главным образом цели демонстрирования решительных репрессивных мер…
По отношению к подозрительным по бандитизму элементам (дезертиры и т. д.) применять как основную меру приговор мужчин к принудительным работам обязательно на определенный срок (на год-полтора)». А в случае побега — конфисковывать имущество семей.
20 июля в связи с разгромом основных сил повстанцев было прекращено действие приказа № 171. Около тысячи повстанцев, еще остававшихся в лесах, в августе — сентябре уничтожались силами ВЧК (ГПУ) или являлись с повинной. Последний отряд из 8 человек распался 8 декабря 1921 г. 24 июня 1922 г. в перестрелке с сотрудниками ОГПУ был убит А. Антонов.
Весной, когда открылась навигация (ее бы кронштадтцам), в район западно-сибирского восстания были переброшены свежие силы РККА, и к июлю 1921 г. оно было подавлено.
Лубков сражался до июня 1921 г., когда его застрелил вошедший в доверие к повстанческому командиру агент ЧК. Сорокинское восстание Новоселова потерпело неудачу в феврале. Но изловить партизана не удалось — он снова скрылся в тайге. В октябре выступил снова во главе отряда в 1500 человек. Потерпев поражение, он в 1922 г. скрылся.
