11 июля 191 года принято постановление ЦК «О неблагополучном положении дел в МГБ», а 12 июля 191 года Виктор Семенович Абакумов был арестован, и ему были выдвинуты обвинения в государственной измене, сионистском заговоре в МГБ, в попытках воспрепятствовать разработке дела врачей. Причиной ареста послужил донос Сталину от начальника следственной части по особо важным делам МГБ СССР подполковника М. Д. Рюмина, в котором Абакумов обвинялся в различных преступлениях, главным образом в том, что он тормозил расследование дел о группе врачей и молодежной еврейской организации, якобы готовивших покушения против вождей страны. По некоторым данным, ход доносу дал Г. М. Маленков. Политбюро ЦК ВКП(б) признало показания М. Д. Рюмина объективными, постановило снять Абакумова с должности и передать его дело в суд. Бывший министр был заключен в Лефортовскую тюрьму. Абакумова пытали, держали на морозе и в конце концов превратили в инвалида.
Но долго не могли решить, что с ним делать. Поначалу каждый из кремлевских игроков хотел использовать его в своих интересах. Но потом, видимо, поняли, что он одинаково опасен для всех, и решили избавиться от него.
Процесс в Ленинграде был откровенным фарсом — с участников открытого процесса брали подписку о неразглашении, ни одно ходатайство Абакумова не было удовлетворено, адвокаты почти не вмешивались в ход заседания. Да в этом и не было нужды. Приговор был предопределен, и Абакумова расстреляли в тот же день, когда приговор был оглашен, 19 декабря 194 года. Через пятьдесят лет с него были сняты обвинения в государственной измене.
