Помимо вновь прибывших гардемарин состав училища пополнился морскими кадетами и гардемаринами других рот Гардемаринских классов и Морского училища, оказавшимися на Дальнем Востоке. С другой стороны, часть гардемарин по разным причинам отчислили. Училище начало занятия в составе 129 человек. Помимо обучения гардемаринам пришлось принимать участие и в боевых действиях против партизан и в подавлении восстаний генерала Р. Гайды (17–18 ноября 1919 г.) и Егерского батальона (25–26 января 1920 г.). Летом 1919 г. был произведен набор во 2-ю, младшую роту училища. Одновременно гардемарины проходили практику на кораблях Сибирской флотилии.
После падения власти Колчака и приближения к городу красных партизан возникла угроза и для существования Морского училища. Последовало решение эвакуировать его на вспомогательном крейсере «Орел» и посыльном судне «Якут». При эвакуации 31 января 1920 г. училище насчитывало свыше 40 офицеров и более 250 кадет и гардемарин. Подробное описание этого отважного, очень сложного и полного опасных приключений похода двух кораблей достаточно изучено. Отметим только следующее — в Сингапуре 11 апреля 1920 г. был произведен первый выпуск 119 человек в корабельные гардемарины (начальник отряда не имел права присвоить им чин мичмана). Этот выпуск получил неофициальное название в честь начальника Морского училища, известною русского подводника капитана 1-го ранга М.А. Китицына — «Китицынский».
12 августа «Орел» и «Якут» пришли в югославский порт Дубровник, где командование флота, находящееся в Севастополе, приказало вернуть мобилизованный в начале войны «Орел» Добровольному флоту. Путь в Севастополь продолжил только «Якут». Большая часть гардемарин и корабельных гардемарин, считая дальнейшую борьбу бесполезной, отказалась следовать в Крым Они предпочли решать свою дальнейшую судьбу самостоятельно. Вместе с Китицыным в Крым прибыли 111 (по другим данным — 96) гардемарин. «Якут» пришел в Севастополь за пять дней до общей эвакуации Крыма.
Уже во время перехода в Константинополь 49 гардемарин приказом генерала Врангеля произвели в мичмана. Часть гардемарин, не закончивших военно-морского образования, продолжила обучение в стенах Морского корпуса, разместившегося в Бизерте, составив в нем отдельную «владивостокскую» роту. Из числа «владивостокских» гардемарин в Бизерте были произведены в мичманы в 1922 г. 45 человек (2 выпуска), многие из которых продолжили флотскую службу в других странах. После ликвидации Русской эскадры и Корпуса в Бизерте, несмотря на то, что гардемарины «Китицынского» выпуска рассеялись по всему миру, они старались не терять между собой связи. Именно благодаря этому о героической эпопее Морского училища во Владивостоке существует наибольшее количество опубликованных воспоминаний. С героями этого выпуска мы еще не раз встретимся на страницах книги.
Морской кадетский корпус в Севастополе, созданный в 1915 г., возродился летом 1919 г., в период наибольших успехов Вооруженных сил Юга России. 15 июня 1919 г. власть белых была установлена в Севастополе. Началось восстановление морских сил на Черном море. Естественно, перед командованием флота встал вопрос подготовки кадров. Впрочем, в условиях Гражданской войны решить его оказалось чрезвычайно трудно. По свидетельству П.А. Варнека, возрождению Морского кадетского корпуса способствовало «…случайное посещение старш[им] лейт[енантом] Н.Н. Машуковым, одним из наиболее энергичных офицеров флота Добровольческой армии, огромного недостроенного здания Морского Кадетского Корпуса в Севастополе». Благодаря поистине титаническим усилиям Н.Н. Машукова, корпус открылся 17 октября 1919 г. Как писал Варнек, «на разграбленной территории Юга России было очень трудно собрать всю материальную часть. Все же постепенно, здесь и там удавалось собрать необходимое. Из складов Юго-Западного фронта в Одессе было получено постельное и носильное белье. Союз Земств и Городов предоставил столовую посуду и кухонную утварь. От училищ города удалось получить назад кое-что из мебели и учебных пособий, переданных им в момент ликвидации Корпуса. Из частных пожертвований севастопольских жителей удалось составить библиотеку в 3500 томов. Наконец английская база в Новороссийске дала солдатское обмундирование и небольшое количество голландок и матросских брюк; от французов было получено некоторое количество синих брюк. Каждая мелочь, тетрадки, карандаши или лампочки требовали поисков и переписки, так как в Крыму во всем был большой недостаток…