1794 – многократно отличился в боях. В том же году отстранен от командования за попустительство грабежам, проводимым французскими солдатами. Кроме того, обвинен в неоправданной жестокости по отношению к белоэмигрантам.
1797 – Комитетом общественного спасения восстановлен на службе. В армии Рейна и Мозеля, где весьма успешно действует против австрийцев.
1799 – произведен в дивизионные генералы, и это, увы, последнее продвижение по службе знаменитого генерала, скверный характер, систематически допускаемые жестокости по отношению к мирному населению остановят его служебный рост. Командующий левым флангом Дунайской армии. По халатности в сопровождении нескольких драгун напоролся на авангард неприятеля и был вынужден один сражаться с 8 австрийскими драгунами, от которых сумел отбиться. За допущенную халатность и постоянно получаемые жалобы от населения отстранен от командования, но через месяц восстановлен и переведен в Северную армию под начало генерала Брюна, участвовал в отражении русского десанта в Голландии, где захватил в плен русского главнокомандующего генерала Германа со всем штабом и около тысячи русских солдат.
1800 – переведен в Рейнскую армию генерала Моро.
1801 – командующий авангардом резервной армии в Шплюнгене.
Участвовал в перевороте, приведшем к власти Бонапарта.
1804 – великий офицер Почетного легиона. Командующий 2-й дивизией Булонского лагеря для подготовки десанта в Англию.
1805 – приписан к 4-му корпусу Великой армии, в авангарде французского наступления против австро-русских сил. Отличился при Аустерлице, за что его часть была награждена императорским орлом.
1806–1807 – под началом Жерома Бонапарта, Большой крест Вюртембергского Королевства.
1807 – после Тильзитского мира командующий 16-м военным округом.
1808 – командующий Булонским лагерем.
1809 – во главе вюртембергского корпуса участвует в австрийской кампании. Отличился при Абенсберге, Экмюле и Урфаре. По окончании кампании вернулся в Булонь, где силой выселил мэра города из своего дома. В результате жалобы мэра, поданной Наполеону, отстранен от командования Булонским лагерем и переведен командующим 14-го военного округа.
1810 – получил титул граф Юненбургский.
1812 – командующий вестфальскими частями в корпусе Жерома Бонапарта в русскую кампанию. Последняя надежда генерала на маршальский жезл, в котором ему уже не раз отказывали. Но еще до вступления в Россию части Вандама уже отметились грабежом населения в Польше. По вступлении в Гродно Вандаму вновь было поставлено на вид о недопущении грабежей населения, в ответ Вандам резко обратился к Жерому Бонапарту, обвинив того в недостаточном снабжении частей, что и провоцирует грабежи. За неподобающее поведение с королем Вестфалии отстранен от командования. Армию не покинул, надеясь в боевых условиях вернуть свой пост. Однако теперь уже за неудачные действия против Багратиона Жером Бонапарт покинул армию. Вандаму было приказано до новых указаний убыть в Варшаву, где он и дождался возврата остатков Великой армии из России.
1813 – командующий 1-м корпусом Великой армии. Удачно действует против союзников в Гамбурге. Развивает наступление против Русской армии в Богемии. Отмечается грабежами и зверствами против немецкого населения. В том числе сумел ограбить дом отца полковника Гейсмара. В августе у города Кульм, ныне чешский Хлум, частями Барклая де Толли под командованием генералов Ермолова и Остерман-Толстого разбит и взят в плен со всем штабом. О пленении Вандама в наполеоновской истории бродит легенда о его дерзком поведении перед царем. По первой, когда генерала привели к царю и его брату царевичу Константину, которым он показал некий тайный масонский знак, царь практически обнял и расцеловал Вандама. По второй, царь начал упрекать Вандама в том, что у него слава как у бандита превосходит славу героя, на что в ответ Вандам стал упрекать царя отцеубийством. Царь рассвирепел и отправил генерала в Сибирь. Ни та, ни другая легенда не подтверждается ни документами, ни на уровне мемуаров. В плену Вандам провел 9 месяцев, из них 5 в Москве и 4 в Вятке, куда был выслан губернатором Москвы Ростопчиным за «разгульное» поведение.
