Поодаль за оградой сосредоточились наряды полиции. Закончив митинг, студенты, соблюдая порядок, шеренгами направились обратно к университету.
Когда адрес студентов к министру просвещения был окончательно подготовлен, трое студенческих депутатов пришли к попечителю Исакову с просьбой его рассмотреть. Попечитель резко ответил: "Никакого прошения я не приму и с депутатами говорить не намерен!" Сообщение об этом вызвало бурю негодования. Студенты огромной толпой устремились в здание нового университета в профессорскую комнату, где находился Исаков. Войноральский с друзьями протиснулся сквозь толпу, и вот они в профессорской комнате. Бросив сумрачный взгляд на студентов, Исаков громко сказал: "Я еще раз повторяю, разговаривать не намерен ни с депутатами, ни с кем-либо из студентов, и, если вы не покинете сейчас же комнату, придется употребить власть и применить к вам военную силу".
Ропот пробежал по студенческим рядам. Они начали наступать на Исакова, пока не прижали его к стене. Войноральский пропустил впереди себя Крыжова как депутата, который обратился к попечителю.
-- В вашей власти одним словом прекратить волнения студентов, не прибегая к крайним мерам, нужна лишь справедливость.
Войноральский вырвался вперед: "Бесчеловечно лишать бедных студентов права учиться!"
-- Я не могу ничего добавить, -- ответил Исаков, -- ибо если я отвечу утвердительно, то я солгу, а лгать я не намерен: против силы я должен сам действовать силой!
Фактически студентам было брошено и лицо обвинение в насилии, в безнравственных, недостойных действиях. Кто-то крикнул: "Подлец! Сын палача!" Поняв всю бесполезность разговора с попечителем, студенты начали расходиться.
Разговор в профессорской комнате не остался без последствий. Исаков отправился к генерал-губернатору и обратился к нему с просьбой арестовать студентов по представленному им списку.
Собравшиеся утром 12 октября около университета студенты узнали, что в прошедшую ночь арестовано около 10 участников вчерашних событий. Студенты обратились к Исакову, желая узнать о причинах арестов. Но Исаков отказался от всяких объяснений. Волнуясь за судьбу товарищей, студенты направились к дому генерал-губернатора. Они видели, что у манежа сосредоточены войска, а следом за ними двинулась полиция. Кольцо замкнулось. Но не идти было нельзя.
Войноральский увидел, как несколько человек вбежали на парадное крыльцо дома Тучкова, И в этот момент полиция и конные жандармы неожиданно напали на студентов. На них обрушились кулаки и сабли. Ряды студентов были смяты. На глазах у Войноральского студент с разбитым лицом упал на землю. Его поволокли в Тверскую полицейскую часть, схватив за руку и за волосы. Прибыл батальон солдат, затем еще две роты московского гарнизона. Конные жандармы, врезавшись в ряды студентов, сбивали с ног одного за другим. Жандармские лошади наступали прямо на упавших, сбитых с ног студентов. Не удалось уйти и Войноральскому с Загибаловым. Их поволокли в Тверскую полицейскую часть. По дороге Войноральский видел, как схватили Крыжова. Он кричал, что может идти сам. Но его с размаху ударили саблей. Крыжов повалился на землю, его потащили. Некоторые студенты защищались палками. Им даже удалось стащить с лошади одного жандарма. Но что могли сделать безоружные студенты? Полиция натравливала на студентов дворников, сторожей, ломовиков, приказчиков, купцов-охотнорядцев. Среди погромщиков действовали переодетые полицейские, распускавшие слухи, будто демонстранты требуют возвращения крепостного права и идут резать генерал-губернатора. Избиение студентов продолжалось целый день и на Большой Дмитровке, и в разных переулках у Бронной. Было арестовано свыше 300 студентов.
Дмитрий Юрасов явился в полицейское отделение, объявив, что желает разделить участь товарищей. Также поступили и некоторые другие студенты. Полиция записывала только их адреса, объявив, что вызовет, когда будет нужно. Задержанных допрашивали, не давая читать протоколы допроса. 39 человек комиссия оставила под арестом, остальных выпустила. Студентам, заключенным в казематы Тверской полицейской части, два дня не давали никакой пищи. Больного Крыжова только на третий день, совершенно обессиленного, отправили в полицейский лазарет. Он двое суток был без сознания. Потом его перевели в каземат Рогожской полицейской части.
