На первых допросах Войноральский показал, что поехал в Петербург с целью поступления в институт, но случайно в гостинице познакомился с человеком, который и дал ему книги, оказавшиеся запрещенными. Рассказывая дальше о своей деятельности в Петербурге, Москве, Саратове, Пензе, Тамбове, Самаре и в населенных пунктах губерний Поволжья, Войноральский подчеркивал, что, кроме него, никто из его знакомых не имел никакого отношения к революционной деятельности.
На одном из допросов Войноральского спросили:
-- Что же Мышкин -- владелец типографии, не знал, что у него печатаются запрещенные сочинения?
-- Мышкин был занят изданием брошюры об отношении господина к прислуге, составленной из уже опубликованных в газетах и журналах материалов. Он думал, что эту книгу цензура несомненно пропустит. Мышкин был далек от издания сочинений революционного характера. Его типография терпела убытки, и я предложил ему напечатать "Историю одного французского крестьянина" и под каким-то придуманным названием хронику общественной жизни в России из первого номера журнала "Вперед". Мышкину некогда было знакомиться с содержанием заказанных мною книг. Объяснять цель, с которой я дал Мышкину означенный заказ, я отказываюсь.
-- А откуда у Вас бланк, найденный в Вашем портфеле?
-- Это один из образчиков, взятых мной у Мышкина для показа в волостном правлении, а именно бланк Московской губернской земской управы. Я сообщил Мышкину, что, будучи в Пензенской губернии, получил от волостного правления заказы бланков для паспортов. Предложение мое Мышкин исполнил, нисколько не подозревая, что заказ волостного правления -- выдумка и что это я заказывал для себя.
-- С какой же целью Вы использовали эти бланки?
-- Я познакомился с молодыми людьми, которые хотели научиться труду рабочих, чтобы ближе познакомиться с их бытом. Я предложил им обучиться сапожному делу в открытой мной в Саратове мастерской. Я же посоветовал этим молодым людям сменить одежду и дал оформленные мной на бланках паспорта --"фальшивые виды".
-- А как же оказались в Вашей мастерской революционные сочинения? Говорите правду и не надейтесь, что Вам удастся ее скрыть. Все ваши товарищи во всем признались, а Вы усугубляете свое положение. Или Вам непременно хочется попасть на каторгу?
-- Когда я выехал из Москвы в Саратов вместе с женой, Селивановым и Юлией Прушакевич, то захватил с собой из типографии часть готового тиража нелегальных изданий и сдал их в багаж под видом зельтерской воды. Никто не знал, что находится в ящиках, и до моего отъезда в Самарскую губернию багаж не был распечатан. Кроме Саратова, ящики никуда не отправлялись.
-- Во время ареста при Вас были найдены записки, написанные шифром. Дайте их расшифровку! Иначе Вам нельзя будет рассчитывать на какое-либо смягчение сурового наказания. Это вещественное доказательство Вашего преступления! И еще. Объясните, зачем Вы ездили в Ставропольский уезд и чем там занимались.
-- На поставленные вопросы объяснения давать отказываюсь.
-- Вы понимаете, чем это Вам грозит?
-- Это не имеет для меня значения. Отвечать на эти вопросы не намерен.
На дальнейших допросах, когда Войноральскому предъявили письменные показания запуганных жандармами Андрея Кулябко и жены Надежды Павловны, он был вынужден признать ряд фактов, сославшись на провалы в памяти. Но большего жандармские чиновники не могли от него добиться никакими устрашающими мерами.
В связи с тем, что Войноральский был одним из активнейших участников движения, его деятельность отразилась в материалах следствия по нескольким губерниям: Саратовской, Пензенской, Самарской, Симбирской, Тамбовской, а также по Москве и Петербургу.
24 февраля 1875 г. Войноральский был заключен в Петропавловскую крепость в Петербурге, где находился в одиночной камере свыше 10 месяцев. После этого он был переведен в открывшийся летом 1875 г. дом предварительного заключения. Здесь и были размещены в ожидании суда народники.
Деятельный характер Войноральского не позволял ему спокойно ждать конца следствия. Он решил бежать. Ему и Ковалику удалось привлечь на свою сторону двух тюремных надзирателей -- Мельникова и Ерофеева. Товарищ прокурора распорядился разместить Войноральского и Ковалика на разных этажах дома предварительного заключения и подальше друг от друга. Однако благодаря стараниям надзирателей камера Войноральского оказалась под камерой Ковалика, и друзья могли общаться между собой перестукиванием по трубам вентиляции.
