Тем временем Моро отступает в Пьемонт и занимает сильную оборону, опираясь на крепости Аллесандрия и Верона. Суворов даёт отдых армии в Милане. Вновь побеждает Моро, и после непродолжительной осады, занимает город Аллесандрия, почти что сходу, проскочив малоприметную деревушку Маренго, не зная, что ей суждено стать звездой Наполеона. Сама деревенька была занята отрядом Багратиона.
Далее в течение 3-х месяцев, армия Суворова сводит на нет все предыдущие завоевания Бонапарта за 20 месяцев. (В 1800 году, что бы вернуть всё это он вновь потратит более полугода).
В это же время эскадра Ушакова высаживает десант на юге Италии. Отряд под командой капитана 2-го ранга А. Сорокина занимает город Бриндизи. Отряд контр-адмирала П. Пустошкина Анкону, а отряд капитана 2-го ранга Г.Г. Белли занимает Манфредонию и движется к Неаполю, столице Неаполитанского королевства (в то время, столица Партенопейской республики).
В июне ситуация достигла кульминации. Суворов в тяжелой четырёхдневной битве разбивает части генерала Макдональда, пришедшие на помощь Моро у Треббии, и вступает в Турин столицу Пьемонта. Макдональд с остатками войск запирается в Генуе, которую с моря блокирует Нельсон. Королевская неаполитанская армия при поддержке русского отряда под командованием капитана 2-го ранга Г. Г. Белли занимают Неаполь. Эскадра адмирала Тета, соединяется с эскадрой адмирала Макарова в Балтийском море, а затем на подходе к Голландии, они соединяются с английской эскадрой адмирала Дункана и блокируют голландское побережье. На севере Франции возникает спрос на учителей русского языка. Бонапарт прекращает безуспешную осаду Сен Жан д'Акра и возвращается в Каир.
В Париже паника. Предпринимается попытка государственного переворота. Дни Директории сочтены. Талейран подаёт в отставку с поста министра иностранных дел и целиком посвящает себя раздумьям как подобрать, ускользающую у Директории власть. Сама Директория начинает судорожные перестройки своей власти. Сийес срочно вызван из Берлина. Число директоров сокращают с пяти до трёх. Для поднятия авторитета предлагается поставить во главе прославленного генерала. Из прославленных в наличие имеется только что разбитый Суворовым и отстранённый от командования Моро, но он отказывается от такой чести. Военный министр Бернадотт+8, в 1797 году доставивший Директории австрийские знамёна, захваченные в Италии войсками Наполеона, ведёт себя слишком независимо. Остаётся 30-летний Жубер, участник бонапартовской кампании 1796-97 гг. Но ему, по выражению Талейрана, не хватает блеска. За "блеском" он отправляется с тридцати пятитысячным отрядом на помощь Макдональду, и соединяется с ним у Нови.
Тем временем, Суворов, взял Падую и тем самым занял всю северную Италию, кроме осаждённой Генуи. В России ликование. Царь в восторге и пожаловал Суворову звание генералиссимуса и титул князя Италийского. Сардинский король, уже простившийся со своей короной, в запале награждает Суворова чином фельдмаршала сардинских войск и титулом потомственного принца и брата королевского, что возрождает неприязнь к полководцу со стороны придворной элиты и Павла I
На севере, после прибытия к англо-русскому флоту эскадр Чичагова и Попхэма усилились активные действия. Сопротивление голландско-французского флота подавлено, береговые укрепления слабы (впоследствии они будут полностью перестроены Наполеоном). Высаживается совместный англо-русский десант. Отряд под командованием капитана 1-го ранга Я. Карпова захватывает крепость на острове Тексель, и десант начинает движение в глубь материка. Всё это вместе начинает не нравиться Англии и Австрии, у которых дела не так блестящи. Обоим не нравится возросшее влияние России, обе опасаются, что в случае успеха Италия остаётся за ней. Балканские славяне, как австрийские подданные, так и турецкие открыто выражают симпатии России. Кроме того, усиливаются общие трения между союзниками по коалиции - они уже расходятся во взглядах на то, как делить будущую победу.
В июле в Египте турецкий десант, не поддержанный англичанами, терпит неудачу при высадке в Абукире. Бонапарт добивается долгое время не хватавшей ему победы. Англия отводит свой флот на блокаду Генуи и размыкает блокаду Бонапарта в Египте, провоцируя последнего на возвращение во Францию (в том числе широко известной романтической историей о Жозефине). Десант в Голландии так же не получает необходимой поддержки и наступление теряет темп. В Европе Австрия начинает раздражать Суворова непоследовательными распоряжениями.