Очень скоро турецкой полиции удалось напасть на верный след. Были арестованы руководители взорвавшегося боевика, некий студент Абдурахман и его помощник парикмахер Сулейман. На допросах арестованные показали что были завербованы сотрудниками советского генерального консульства и торгпредства Корниловым и Павловым, которые являлись главными организаторами покушения на фон Папена. Турецкие власти объявили советскому посольству ультиматум о выдаче Павлова и Корнилова для суда над ними. Это требование было выполнено.
В апреле 1942 года Павлов, Корнилов, Абдурахман и Сулейман предстали перед судом по обвинению в покушении на германского посла. В ходе судебного разбирательства, длившегося целый месяц, Павлов и Корнилов категорически отрицали свою вину, в то время как Абдурахман и Сулейман ее подтверждали. В результате суд признал всех обвиняемых виновными. Сотрудники советских учреждений были приговорены к 20 годам заключения каждый, а студент и парикмахер «схлопотали» по 10 лет (в августе 1944 года Павлов и Корнилов были освобождены из тюрьмы и возвратились в Москву).
Вдобавок, к неудавшемуся покушению, 3 мая 1942 года сотрудник резидентуры Разведупра РККА в Анкаре И. Ахмедов обратился к турецким властям с просьбой о политическом убежище. Предатель рассказал туркам все, что знал о работе резидентур ГРУ и ИНО НКВД в Турции, выдал двух нелегалов и пояснил причину того, почему фон Папен остался жив. Оказалось, что уровень подготовки Токката был крайне низок. Боевик слишком рано снял предохранитель бомбы, в результате чего взорвался сам. «Ему бы камнями бросаться, а ему взрывное устройство всучили», — хихикал предатель.
Неудачная операция по ликвидации фон Папе на вызвала гнев Сталина и Берии. Над головой Наума Эйтингона сгущались грозовые тучи. Павлу Судоплатову стоило великих трудов отстоять своего заместителя.
Из других операций 4-го Управления можно отметить одну, проходившую под кодовым названием «Монастырь», проводившуюся под личным руководством Павла Судоплатова. В ходе ее на территории СССР было «инсценировано создание подпольной антисоветской профашистской организации, искавшей контактов с гитлеровским командованием. Главную роль в операции сыграл давний агент ОГПУ-НКВД Александр Демьянов, сын царского офицера, накануне войны завербованный немецкой разведкой. В конце 1941 года он на лыжах перешел через линию фронта к немцам, прошел ускоренное обучение в разведшколе абвера и в феврале 1942 года был выброшен на парашюте в районе Ярославля. Его задачей была организация резидентуры абвера в Москве. В результате с его помощью были арестованы многие агенты абвера, кроме того, велась активная радиоигра по дезинформации немецкого командования. До самого конца войны руководство абвера так и не догадалось об истинной роли Демьянова, а бывший начальник разведки ФРГ Р. Гелен в своих мемуарах высоко оценил достижения агента Макса (псевдоним Демьянова в абвере)».[33]
Стоит также добавить, что Павел Судоплатов руководил операциями не только из кабинета. Случалось ему бывать и под пулями, на передовой. Например, так, как это было во время его нахождения на Северном Кавказе в августе-сентябре 1942 года. Тогда одно из диверсионных подразделений НКВД получило приказ о подрыве нефтяных скважин и буровых вышек в районе Моздока. При минировании важного стратегического объекта лично присутствовали первый заместитель Берии В. Н. Меркулов и начальник 4-го Управления НКВД П. А. Судоплатов. Взрыв скважин был произведен в тот момент, когда к ним приблизились немецкие мотоциклисты. Меркулов и Судоплатов присоединились к диверсионной группе, отходящей в горы, в последний момент.
За выполнение этой операции Сталин объявил Меркулову выговор, поскольку тот подвергал свою жизнь неоправданному риску и мог быть захвачен в плен, а Берия устроил разнос Судоплатову. Тем не менее, в результате успешных действий по каналам разведки пришло сообщение, что немцы не смогли использовать нефтяные запасы и скважины Северного Кавказа, на которые очень рассчитывали.
В январе 1945 года приказом НКВД СССР № 0028 комиссару госбезопасности 3-го ранга Павлу Судоплатову было поручено координировать работу центральных аппаратов НКВД и НКГБ по обеспечению проведения Крымской конференции союзников. В связи с этим Судоплатов под именем Павла Матвеева, помощника Молотова, провел ряд встреч с послом США в СССР А. Гарриманом, главой американской военной миссии в Москве генералом Дином, контр-адмиралом Олсеном и советником британского посольства Робертсом. Павел Анатольевич вспоминал: