6 апреля он приехал в Бендеры, а затем в Тирасполь. В Бендерах он встретился с председателем ВС ПМР Г.С. Маракуцей и депутатами городского совета. На встрече он говорил о том, что Молдова даже рассматривать не хочет по отношению к ПМР такое понятие, как «республика», и советовал согласиться на определение типа «области или край» в составе Молдовы.
В Тирасполе он встретился с женщинами Приднестровья, где заявил: «Уважаемые и горячо любимые соотечественницы! Мы знаем вашу боль, думаем о вас, мы вас не бросим. Будем и дальше участвовать в переговорах как глубоко заинтересованная сторона. Сегодня мы договорились о том, что в 15.00 прекратится обстрел и начнется вывод вооруженных формирований. В буферную зону войдут войска. Затем продолжится переговорный процесс, и мы еще не раз будем встречаться».
После этого в клубе 183-го мсп он встретился с офицерами 59-й мотострелковой дивизии. На встрече офицеры предложили, чтобы 14-я армия официально стала между враждующими сторонами наподобие голубых касок. Козырев ушел от прямого ответа и сказал, что этот вопрос будет проработан на соответствующем уровне.
7 апреля в Кишиневе произошла встреча министров иностранных дел России, Украины, Молдовы и Румынии, на которой присутствовала и делегация от Приднестровья. Принята «Декларация по Приднестровью». ПМР был гарантирован статус свободной экономической зоны. На линию противостояния сторон были приглашены военные наблюдатели от Украины, Румынии, России, Молдовы и ПМР. Им была поставлена задача отслеживать соблюдение противоборствующими сторонами условий достигнутых договоренностей. В дальнейшем, как показало время, военные наблюдатели со своей задачей не справились.
По завершении поездки в Республику Молдова А.В. Козырев пренебрежительно заявил в газете «Известия»: «Эти люди живут в отрыве от реальности», «Руцкой вселил в приднестровцев надежды и вызвал рост антирусских настроений в Молдове». Для министра иностранных дел России важнее было мнение Молдовы и Запада, чем судьба 750 тысяч человек, среди которых были и россияне, проживающие на левом берегу Днестра.
12 апреля между Республикой Молдова и Приднестровской Молдавской Республикой был подписан так называемый «апрельский протокол» о перемирии. В работе сессии городского совета Бендер участвовал и командующий 14-й армией генерал Ю.М. Неткачёв. Он фактически подтолкнул власти города к подписанию протокола, заверив всех, что в случае чего военные город в обиду не дадут. Но в июне генерал Ю.М. Неткачёв напрочь забыл про все свои обещания.
Согласно протоколу город снимал блокпосты, разоружал и расформировывал военные формирования, а все оружие складировал в казармах под присмотром военных наблюдателей.
23 апреля группой молдавских террористов днем в селе Карагаш был смертельно ранен председатель Слободзейского райисполкома Н.И. Остапенко.
В начале мая ко мне пришел начальник артиллерии ПМР полковник запаса Владимир Дмитриевич Комиссаров (бывший начальник штаба РВиА 14-й армии). Мы прекрасно понимали, что шаткое перемирие, которое было достигнуто между Молдовой и Приднестровьем, долго продолжаться не сможет. У Молдовы был очень большой соблазн все имеющиеся политические проблемы решить силовым путем.
В Молдове знали, что у них большое превосходство в вооружении, технике и личном составе над вооруженными формированиями Приднестровья. Мы с В.Д. Комиссаровым договорились, что артиллеристы ПМР будут готовиться на базе 328-го самоходно-артиллерийского полка (сап) 59-й гв. мотострелковой дивизии. В это время в дивизии как раз проходили сборы с танкистами. Комиссаров организовал через городской военкомат сборы с приписным составом (артиллеристами) и до середины мая готовил своих специалистов.
Этим были достигнуты три цели:
1. Вооруженные формирования ПМР готовили для себя специалистов.
2. Немного утих накал страстей среди местного населения. Люди увидели, что 14-я армия в случае вооруженного конфликта готова прийти к ним на помощь.
3. Был предотвращен несанкционированный захват артиллерийской техники.
Даже тогда, когда толпа женщин и казаков во главе с Г.С. Андреевой пришла в артиллерийский полк за техникой, В.Д. Комиссаров с приписниками, которые были в это время на сборах, не дали вывести технику из парка.
