В 60-е годы скрывать присутствие национал-социалистов стало невозможно. США и Израиль обратились с просьбой выдать некоторых из наиболее одиозных беглецов международному суду. Однако с ведома Стресснера тогдашний шеф Разведотдела Планас предупредил Менгеле и фон Экштайна о запросе в отношении их, а затем парагвайская разведка помогла им перейти на нелегальное положение с новыми документами. Фон Экштайн остался советником парагвайской разведки, работал личным советником президента Стресснера. Эта история имела продолжение, когда служака Политической полиции, выходец из украинских переселенцев Прокопчук собрал целое досье на разыскиваемых нацистов, укрываемых Разведывательным отделом. Прокопчук доложил об этих фактах своему шефу Алуме, возглавлявшему тогда Политическую полицию, и, не найдя у начальства понимания, напрямую передал досье представителям разведок Соединенных Штатов и Израиля. После оказанного на Стресснера политического давления часть немцев в Парагвае перешла в нелегалы. А с сотрудником Политической полиции Прокопчуком расправились люди из Разведотдела. Приказ о ликвидации отдал шеф разведки Кандиа, сменивший на этом посту Планаса, а застрелил Прокопчука в зале одного из асунсьонских кинотеатров киллер из числа хорватских национал-социалистов Контич, работавший на парагвайские спецслужбы.
В течение всего правления Стресснера Парагвай обвиняли в грубом вмешательстве в дела соседей. В том числе и в поддержке военных переворотов Пиночета в Чили и Бансера в Боливии. С конца 70-х годов добавились обвинения в наркобизнесе, в нем оказались замешаны почти вся верхушка парагвайской элиты, руководство армией и спецслужбами. Среди главных покровителей наркомафии называли шефа Политической полиции в 80-е годы Монтатаро, начальника криминального отдела этой спецслужбы Коронело, высокопоставленного офицера разведки и зятя диктатора Родригеса. Родригес в 1989 г. предал своего тестя-президента, участвуя в перевороте, который привел к отстранению пожилого диктатора от власти.
В 1999 г. по приказу нового президента — Макчи — Политическая полиция участвовала в отстранении популярного в армии министра обороны генерала Овьедо. А спустя год та же тайная полиции подавила выступление офицеров из числа сторонников Овьедо, ликвидировав нескольких их лидеров.
В эмирате вопросами разведки и госбезопасности ведают две главные спецслужбы: «Махабет» (Секретная служба) стоит на стаже государственных устоев внутри страны, занимается разведкой и обеспечением охраны семьи Эс-Сабахов, а «Мокхабах» (Военная служба безопасности) занята военной разведкой и контрразведкой. «Мокхабах» подчинен военный «специальный батальон» кувейтских вооруженных сил.
«Махабет» замечена в пытках оппозиционеров и неугодных клану Сабахов лидеров палестинской диаспоры. Преследования радикальных палестинцев, настроенных против союзных Сабахам западных стран во главе с США, в «Махабет» были частью борьбы с терроризмом. Помощь «Махабет» и «Мокхабах» разведке Ирака в тайных операциях в ходе войны с Ираном в 80-е годы объясняется проявлением арабской солидарности.
В 1990 г. Хуссейн напал на вчерашнего союзника, в считанные часы оккупировав Кувейт и объявив его 19-й провинцией Ирака. Эмир Эс-Сабах бежал с семьей и приближенными в Саудовскую Аравию. Сюда же перебралось и руководство двух его спецслужб, почти полгода проработав разведкой правительства в изгнании, их центр располагался в саудовском Эр-Рияде, его возглавил шеф «Махабет» Салем Сабах, двоюродный брат эмира Сабаха Эс-Сабаха. Полгода кувейтская разведка в изгнании проводила акции в своей оккупированной стране, забрасывая с помощью американцев, англичан и саудовцев диверсионные группы через границу. В составе одной из таких групп погиб сын эмира, Фахд Сабах, сотрудник кувейтской разведки. В Эль-Кувейте и провинциях эмирата была оставлена разветвленная подпольная сеть под руководством резидента «Махабет» Дашти. Одними из главных ее терактов должны были стать взрыв в багдадском отеле «Бабел» и убийство сына Саддама Хуссейна — Удея. В Багдад уже была переброшена группа сотрудников «Махабет» и «Мокхабах», а главную скрипку в покушении должна была сыграть кувейтская разведчица Сафи, внедренная в окружение Удея. Но сын диктатора в условленное время в отеле не появился, и акция сорвалась.