В развитие постановления ЦИК и СНК СССР о т. о. от 7 декабря 1931 г., 7 февраля 1932 г. НКТ СССР издал инструкцию, которой детализировал все основные вопросы порядка прохождения службы как тылоополченцев, так и начсостава. Выстроенная гражданскими наркоматами система имела ряд существенных недостатков и в своей организационной структуре, и во всестороннем обеспечении частей, приведших в конечном итоге к катастрофическому положению последних. 16 мая 1933 г. постановлением Президиума ЦКК ВКП(б) и Коллегии НК РКИ СССР «О состоянии военспецчастей тылового ополчения при НКПС и Цудортрансе СССР и бытового разложения ряда работников в аппарате Управлений» была дана оценка деятельности управлений т. о. как НКТ СССР, так и подведомственных ему управлений НКПС и ЦДТ. Было отмечено, что в целом установленный метод использования тылоополченцев на работах, имеющих стратегический характер, себя оправдал. Однако вместе с этим получила неудовлетворительную оценку работа НКТ по контролю над деятельностью ЦУТО НКПС и ЦДТ и самих этих управлений[26]. Многие должностные лица управлений были сняты с занимаемых должностей, наказаны в дисциплинарном и партийном порядке.
23 июня 1933 г. постановлением ЦИК, СНК и ВЦСПС «Об объединении Народного комиссариата труда Союза ССР с Всесоюзным центральным советом профессиональных союзов» НКТ был ликвидирован, а все его функции переданы ВЦСПС[27]. В связи с этим среди прочих возник вопрос о передаче функций по руководству т. о. Но ВЦСПС был еще менее приспособлен к управлению военизированными частями, чем НКТ. В такой ситуации вполне логичной была передача т. о. одному ведомству — Наркомату по военным и морским делам.
27 сентября 1933 г. ЦИК и СНК СССР приняли постановление «О тыловом ополчении», проект которого был выработан НКВМ[28]. Текст постановления был коротким, предельно ясным. Содержание его пунктов не давало возможности толковать какое-либо положение двояко, что имело место в предыдущем постановлении (от 7 декабря 1931 г.) и неоднократно приводило к трениям между различными ведомствами (ОГПУ, НКВД, НКТ, НКВМ и др.).
Важной особенностью настоящего постановления явилось то, что, наконец, после двухлетней неопределенности в вопросе восстановления тылоополченцев в избирательных правах в качестве поощрительной меры было введено положение о досрочном восстановлении последних в этих правах. В том случае, если тылоополченцы в течение двух лет пребывания в частях проявили себя дисциплинированными, честными и образцовыми работниками, сознательно относящимися к труду, командиры и комиссары частей могли через вышестоящее командование возбуждать перед ЦИК СССР ходатайства о предоставлении таким тылоополченцам избирательных прав. Это положение впоследствии сыграло большую роль в повышении дисциплины, производительности труда и организации службы в частях т. о.
Начальствующий состав частей тылового ополчения должен был комплектоваться из начальствующего состава РККА и считался состоящим в кадрах РККА. Соответственно на него распространялись все льготы и ответственность, определенные для командиров Красной армии.
Порядок прохождения службы тылоополченцами, их дисциплинарной ответственности регулировался специальными уставами, издаваемыми НКВМ применительно к соответствующим уставам РККА. Совершенные тылоополченцами преступления против установленного порядка службы в частях т. о. признавались воинскими преступлениями и рассматривались судами военного трибунала. С принятием этого постановления постановление ЦИК и СНК СССР от 7 декабря 1931 г. считалось утратившим силу.
27 сентября 1933 г. ЦИК и СНК СССР приняли также постановление «Об изменении закона об обязательной военной службе»[29]. Общий смысл изменений касался замены в пунктах разделов, определяющих порядок привлечения к службе «религиозников» и тылоополченцев, слов «общеполезные работы» на «работы оборонно-стратегического значения». 7 октября 1933 г. вышло постановление СНК СССР «О порядке передачи НКВМ частей тылового ополчения»[30]. Положениями этого постановления предписывалось ликвидировать ЦВУТО при НКТ СССР и ЦУТО других ведомств (НКПС, ЦДТ, НКТП) в связи с передачей т. о. в полное ведение НКВМ. Все ведомства, имевшие в своем подчинении части т. о., были обязаны в месячный срок передать НКВМ все имущество и денежные средства этих частей, а также ликвидировать задолженности частям за выполненную работу. Централизованные продовольственные, вещевые и фуражные фонды снабжения частей т. о. передавались в НКВМ.