В 1931 году после смерти учёного владивостокская газета "Красное Знамя" опубликовала статью, в которой взгляды Арсеньева по национальному вопросу расценивались как откровенно шовинистические и империалистические. Покойному учёному это было безразлично, но во Владивостоке жили его жена Маргарита Николаевна и дочь Наташа, на которых и обрушился гнев властей.
Маргарита Арсеньева была арестована в марте 1934 года. А в феврале 1935 года военный трибунал Особой Краснознамённой Дальневосточной армии выдвинул против неё обвинение:
"В начале 1933 года Экономическим отделом Управления Госбезопасности была вскрыта и ликвидирована контрреволюционная шпион-ско-вредительская организация в различных областях народного хозяйства Дальневосточного края. Показаниями обвиняемых Савича, Огородникова, Батурина и других было подтверждено, что она ставила своей конечной целью свержение Советской власти на ДВК путём вооружённого восстания и японской интервенции. После смерти руководителя В. К. Арсеньева руководство ею осуществляли Савич и Арсеньева".
В. И. Огородников, бывший ректор Дальневосточного государственного университета, и И. М. Савич, профессор того же университета, были приговорены к десяти годам заключения. Друг Арсеньева А. Д. Батурин расстрелян. Маргариту Арсенье-ву почему-то пощадили: её только сняли с работы и лишили паспорта. Однако летом 1937 года её вновь арестовали и приговорили к расстрелу. В конце 1939 года была арестована семнадцатилетняя Наташа Арсеньева. Её осудили на три года за "содержание притона в квартире", но, вроде бы разобравшись, вскоре выпустили.
В 1941 году Наталью Арсеньеву вновь арестовали и осудили на десять лет исправительно-трудовых лагерей. Обвинительное заключение гласило: "Арсеньева, будучи враждебно настроена к Советской власти, среди граждан распространяла антисоветские шовинистические анегдоты" (так в тексте). На свободу она вышла в 1951 году, а через три года снова попала в тюрьму уже по бытовой статье.
27 апреля 1958 года Верховный суд СССР пересмотрел приговор в отношении Маргариты Арсеньевой и отменил его за отсутствием состава преступления. В сентябре 1960 года реабилитировали и Наташу. Она вернулась во Владивосток, где был похоронен её отец.
Позже Наталья Арсеньева жила в Хабаровске и Благовещенске, где и умерла в 1970 году. После её смерти никаких документов, писем и фотографий в её квартире не оказалось. Но благодаря именно ей до наших дней дошла большая часть бесценного научного и литературного наследия В. К. Арсеньева, хотя что-то исчезло безвозвратно. По воспоминаниям первой жены учёного А. Арсеньевой в 1918 году Владимир Клавдиевич зарыл часть своих дневников и рукописей, а также золотые и серебряные медали на даче, в тридцати километрах южнее Хабаровска, а потом не смог отыскать место. Позже предпринимались попытки отыскать этот клад, но они не увенчались успехом. Неизвестно, где находится и так называемая "зелёная книжка" Арсеньева, в которой были "важные записи, касающиеся находок драгоценной руды, пещер смерти, мест, богатых женьшенем". Пропал и план женьшеневой плантации, завещанной учёному его знаменитым проводником Дерсу Узала.
Владимир Клавдиевич Арсеньев.
История арсеньевского архива и библиотеки темна и загадочна. Известно, что 10 сентября 1938 года учёный секретарь Приморского филиала Географического общества СССР обратился к Н. Арсень-евой с просьбой продать архив и библиотеку отца. Есть и заметка в газете "Красное Знамя" от 17 ноября 1938 года, вроде бы подтверждающая состоявшуюся продажу. Однако в архивах сохранилось письмо учёного секретаря ПФГО Н. Навиндовского от 22 марта 1950 года, в котором он упоминает, что архив Арсеньева был приобретён в 1941 году. Трудно предположить, что Навиндовский, спустя всего десять лет, перепутал 1938 и 1941 годы.
Есть и ещё одна публикация в той же газете "Красное Знамя", относящаяся к 17 апреля 1945 года, под названием "Разбор архива В. К. Арсеньева". В статье говорится:
"В краеведческой библиотеке Приморского филиала Всесоюзного географического общества закончен разбор недавно приобретённого личного архива известного дальневосточного писателя, исследователя и краеведа штабс-капитана В. К. Арсеньева".
