Через 40 с после отцепки механизм времени выдавал команду на подключение автопилота ракеты к РЛС самонаведения КС-11М, а двигатель переводился на маршевый режим. Обычно к этому времени ракета достигала скорости 1250 км/ч. С приближением ракеты к цели на расстояние 15 км станция
К-11М выдавала команду на разориен-тирование гироскопа упреждения и управление ракетой производилось уже с учетом скорости цели. Эта же команда использовалась для разблокирования стопорного устройства антенны и после того как ее оптическая ось совмещалась с продольной осью ракеты вновь стопорилась. В таком режиме станция К-11М работала до конца полета ракеты. Когда расстояние до цели сокращалось до 450 м станция КС-11М выдавала команду на отключение радиоуправления и ракета продолжала полет, сохраняя последнее положение еще в течение 1,2 -1,6 с после чего переходила на пикирование.
К освоению ракетного комплекса Ту-16К-16 морская авиация приступила в феврале 1963 г. Начало ему положили летчики, штурманы и инженерно-технический состав 540-го мрап 33 учебного центра, в следующем году к переучиванию приступил 12-й мрап авиации БФ, в 1965 г. эскадрилья мрап авиации ТОФ, второй полк из состава этого флота осваивал новую систему в 1967 г. Всего в авиации ВМФ на комплекс Ту-16К-16 перешли четыре мрап.
Первые практические пуски ракет производились экипажами 33-го учебного центра в период с 25 октября по 23 ноября 1962 г. С поступлением ракет КСР-2 начались работы и исследования, направленные на снижение высоты пуска. Оказалось, что без особых затруднений и доработок ракету можно применять с высоты 2000 м. такая возможность была обоснована теоретически в 33-м учебном центре и проведены практические пуски в 1964 г.
В 1967 г. в Государственном научно-исследовательстком краснознаменном институте проведены пуски ракет с малых высот. Приказом Министра обороны от 22 апреля 1968 г. была утверждена доработка, которая обеспечивала возможность пусков ракет в расширенном диапазоне высот от 500 до 10000 м. Доработанным ракетам присвоили шифр КСР-2М. Благодаря изменениям в конструкции просадка ракеты после пуска уменьшилась до 150-200 м, через 50 с она выходила на высоту пуска, а еще через 40 -50 с оказывалась выше на 500-800 м. В дальнейшем полет происходил по наклонной прямой к цели в режиме самонаведения по курсу и высоте. Практические полеты позволили установить, что минимальная дальность пуска КСР-2М с высоты 500 м ограничивается радиолокационной видимостью цели и временем, затрачиваемым на подготовку ракеты к пуску. Практически она составляла 70-80 км.
Таким образом, на вооружение морской авиации поступил уже третий ракетный комплекс, но и он имел существенные недостатки: подвержен радиоэлектронным помехам, дальность его применения существенно зависела от гидрометеорологических условий, состояния водной поверхности, имела относительно небольшую скорость и др. Однако несмотря на это ракета довольно устойчиво наводилась на корабли, а так как каждая из них могла настраиваться на свою частоту это позволяло применять до 20 ракет без взаимных помех. Для заправки ракет окислителем АК-20Ф использовались специальные заправочные комплексы и только начиная с 1961 г. в этих целях стали применяться ампульные средства заправки окислителем (одна ампула на две ракеты).
Комплекс Ту-16К-16 просуществовал в морской авиации относительно недолго поскольку его недостатки оказались слишком явными. Он прошел "практическую проверку" во время войны Египта с Израилем в 1973 г. Неизвестно по каким целям и с каким результатом произведено 82 пуска ракет. Следует отметить, что ракеты, переданные Египту вообще имели только одну частоту и подобного рода кастрация экспортного варианта произведена не без участия оперативного отдела штаба авиации ВМФ.
В 1963 г. началась разработка ракеты К-11, вошедшей составной частью в ракетный комплекс Ту-16К-11-16. таким образом, в 1965 г. в морской авиации появился совмещенный ракетный комплекс.
Ракета К-11 предназначалась для поражения работающих наземных и корабельных РЛС. В носовой части самолета и отсеке передней ноги шасси разместили бло.и станции радиотехнической разведки и целеуказания "Рица". С тем, чтобы сохранить центровку самолета в допустимых для безопасной эксплуатации самолета пределах пришлось снять совершенно бесполезную во всех отношениях носовую пушку АМ-23.
