"Цзинъюань" около 16 часов попал под сосредоточенный огонь японского "Летучего отряда". Крейсер "Такатихо" обстреливал его с дистанции 3100 м, а "Ёсино" - с 2300 м. В 16.48 "Цзинъюань" накренился на правый борт, в средней части корпуса и в корме бушевали пожары. Руль не действовал, и крейсер описывал циркуляцию. Флаг-офицер адмирала Ито так описывал дальнейшее: "Китайские артиллеристы стреляли из пушек до самого конца, когда "Цзинъюань" медленно погрузился, кормой вперед, нос же судна еще минуты полторы выставлялся из воды, пока наконец не погрузился разом и он". Японцы больше всего гордились этим достижением, называя его "единственной победой крейсера над броненосцем" и подчеркивая тот факт, что "Цзинъюань" был уничтожен исключительно артиллерийским огнем[1 Китайцы, напротив, приняли взрыв котлов крейсера за попадание торпеды.]. Вместе с крейсером погибли его командир Линь Юншэн и более 230 членов экипажа. Никто не выжил, хотя, по другим данным, на месте потопления корабля все же были подобраны 7 моряков.
К 17 часам диспозиция Бэйянского флота была такова: в строю оставались только броненосцы, крейсера "Цзинъюань" и "Гуанцзя" позорно удирали, а "Лайюань", бронепалубный "Цзинъюань" и небольшой "Пинъюань" продолжали тушить пожары, медленно двигаясь в сторону Порт-Артура. Около 17.30 японцы прекратили бой и занялись устранением полученных повреждений. Китайские броненосцы направились в Порт-Артур, по пути собрав уцелевшие корабли в некое подобие соединения[2 Поскольку флагман полностью лишился рангоута, флаг командующего пришлось поднять на бронепалубном крейсере "Цзинъюань".].
В 9 часов утра 18 сентября основные силы Бэйянского флота добрались до ближайшей базы. "Лайюань" представлял собой страшное зрелище: весь корпус и надстройки, по выражению того же Вильсона, "имели вид скорлупы". Причина столь разрушительного пожара крылась в неисполнении экипажем приказа адмирала Дин Жучана, отданного незадолго до сражения, - избавить палубы от деревянных вещей. Броненосные крейсера несли щегольские палубные настилы из толстых тиковых досок, которые служили предметом гордости и заботы экипажей. Вместе с лакокрасочными изделиями, потраченными при наведении красоты, это дерево послужило отличной пищей для огня. Механизмы и система управления не пострадали благодаря броневой палубе и упорству команды. Кочегарам и машинистам пришлось несколько часов трудиться в адских условиях, командование ими взял на себя первый лейтенант крейсера Се Баочжан. При обследовании в Порт-Артуре на корабле было обнаружено 225 попаданий, а убыль экипажа составила 17 человек убитыми и 28 ранеными.
Самоотверженная работа судоремонтников позволила Бэйянскому флоту уйти в Вэйхайвэй уже 18 октября 1894 г., задолго до захвата Порт-Артура японцами. "Лайюань" успел закончить лишь самые необходимые работы, касающиеся восстановления боеспособности. Условия обитания на выгоревшем крейсере с наступлением зимы были крайне тяжелыми. Несмотря на это, экипаж активно поддерживал огнем китайские войска, защищавшие материковые укрепления базы. Чэнь Юэ даже утверждает, что именно выстрелом из 210-мм орудия "Лайюаня" был убит генерал-майор Одэра Ясудзуми - самый высокопоставленный из погибших участников осады Вэйхайвэя. Однако командир 11-го пехотного полка императорской армии пал 9 февраля 1895 г., тогда как судьба "Лайюаня" решилась несколькими днями ранее.
С началом блокады Вэйхайвэя японское морское командование поставило задачу нейтрализации остатков Бэйянского флота, укрывавшихся под берегом о-ва Люгундао. Для этого решено было задействовать миноносцы. Проходы, соединявшие внутреннюю гавань Вэйхайвэя с морем, прикрывались двумя рядами минных заграждений и плавучим боном. Первая попытка ночной атаки не удалась, однако японцы не сдавались и в ночь на 4 февраля 1895 г. смогли подорвать броненосец "Динъюань". Третья атака была назначена на 6 февраля. Накануне командир японского минного отряда тщательно изучил китайские заграждения с материкового берега и наметил план операции. К участию в ней были назначены миноносцы № 7, 11, 13, 23, а также миноносец I класса "Котака". Операция началась в 4 часа утра, вскоре после этого на миноносце №7 лопнул штуртрос, и ему пришлось повернуть назад. Остальные не без труда смогли проникнуть в акваторию базы. При этом миноносец №23 трижды оказывался в лучах китайского прожектора, однако тревога была поднята только тогда, когда японцы приблизились к месту стоянки бэйянских кораблей на расстояние 300 м. К тому времени миноносцы разделились: №11 и №13 занялись поисками броненосца "Чжэньюань", а №23 и "Котака" проникли в восточную часть гавани.